More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4708 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  100 
 
 		 219 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  89.09 
 
 		 220 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  73.27 
 
 		 213 aa  308  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  64.37 
 
 		 247 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  64.41 
 
 		 238 aa  274  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  62.18 
 
 		 235 aa  263  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  64.62 
 
 		 196 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  63.13 
 
 		 235 aa  248  7e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  59.91 
 
 		 234 aa  245  4e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  47.39 
 
 		 190 aa  187  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  46.41 
 
 		 195 aa  187  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  47.37 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  47.37 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  46.41 
 
 		 192 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  47.37 
 
 		 190 aa  181  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  52.67 
 
 		 195 aa  169  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  52.67 
 
 		 196 aa  169  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  53.33 
 
 		 187 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  49.33 
 
 		 196 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  52 
 
 		 191 aa  162  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  41.35 
 
 		 191 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  40.38 
 
 		 191 aa  161  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  49.33 
 
 		 189 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  47.74 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  46.3 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  41.06 
 
 		 200 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  42.58 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  37.87 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  48.34 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  37.28 
 
 		 185 aa  126  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  41.18 
 
 		 221 aa  124  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  42.48 
 
 		 192 aa  124  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  38.71 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  39.33 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  36.16 
 
 		 193 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  42.47 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  35.98 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  35.53 
 
 		 153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  36 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  39.33 
 
 		 178 aa  109  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  35.53 
 
 		 177 aa  108  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  35.71 
 
 		 178 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  36 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  42.24 
 
 		 419 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  36.48 
 
 		 205 aa  99  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  40.8 
 
 		 437 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  34.21 
 
 		 192 aa  97.1  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  40.83 
 
 		 422 aa  95.5  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  37.72 
 
 		 455 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  37.72 
 
 		 455 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  31.68 
 
 		 184 aa  92  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  37.98 
 
 		 427 aa  90.9  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  37.5 
 
 		 439 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  44.63 
 
 		 816 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  37.5 
 
 		 426 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  38.62 
 
 		 264 aa  86.3  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  36.49 
 
 		 452 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  37.58 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  34.17 
 
 		 435 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  34.92 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  37.29 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  31.09 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  35.76 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6413  polysaccharide export protein  32.21 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  40 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  29.82 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  40 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  40 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  37.86 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  31.32 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  34.36 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  29.27 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  39.04 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  28.66 
 
 		 249 aa  72  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 268 aa  72  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  30.94 
 
 		 212 aa  72  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  39.34 
 
 		 277 aa  71.6  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 252 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2077  polysaccharide export protein  35.45 
 
 		 260 aa  71.6  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00598024  normal  0.432742 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  35.85 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  31.22 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  32.54 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  28.34 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  26.92 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  27.07 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  28.7 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  40.37 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  34.92 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  31.71 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.74 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  33.96 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  33.12 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  37.17 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  33.96 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  34.15 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  31.03 
 
 		 417 aa  68.6  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1588  polysaccharide export protein  33.7 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  33.97 
 
 		 277 aa  68.2  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  38.1 
 
 		 441 aa  68.2  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  33.81 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>