262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2077 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_2077  polysaccharide export protein  100 
 
 
260 aa  531  1e-150  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00598024  normal  0.432742 
 
 
-
 
NC_002950  PG0437  BexD/CtrA/VexA family polysaccharide export protein  43.91 
 
 
307 aa  195  6e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0250029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6397  Soluble ligand binding domain protein  36.82 
 
 
265 aa  161  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10728  polysaccharide export outer membrane protein  37.55 
 
 
283 aa  159  4e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0066  polysaccharide export protein  39.02 
 
 
275 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.200434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2358  polysaccharide export periplasmic protein  38.39 
 
 
263 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4765  polysaccharide export periplasmic protein  39.29 
 
 
281 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00350662  normal  0.271358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0727  polysaccharide export protein  35.43 
 
 
276 aa  145  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567222  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4088  polysaccharide export protein  35.04 
 
 
266 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.142355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2665  Soluble ligand binding domain protein  34.87 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.436748  normal  0.303362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2287  polysaccharide export protein  32.66 
 
 
254 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4354  Soluble ligand binding domain protein  36.72 
 
 
266 aa  136  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.76847 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0879  polysaccharide export outer membrane protein  33.49 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146875  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6308  Soluble ligand binding domain protein  31.33 
 
 
276 aa  116  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0361  polysaccharide export protein  30.8 
 
 
263 aa  112  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0845  polysaccharide export protein  31.8 
 
 
253 aa  93.6  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.700264  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07225  polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family protein  32.8 
 
 
257 aa  93.2  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3890  polysaccharide export system outer membrane protein  32.3 
 
 
264 aa  87.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  41.35 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  39.82 
 
 
196 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  40.2 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  35.45 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  35.97 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  35.79 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  35.26 
 
 
379 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  35.26 
 
 
379 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  35.26 
 
 
379 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  35.26 
 
 
386 aa  68.9  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  35.26 
 
 
386 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  37.76 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  35.26 
 
 
379 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  35.26 
 
 
379 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  28.5 
 
 
393 aa  68.9  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  37.25 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  35.57 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  29.53 
 
 
407 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  37.25 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  33.33 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  33.33 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.51 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  33.64 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  33.7 
 
 
377 aa  66.2  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  33.64 
 
 
392 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  40.95 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  31.03 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  31.22 
 
 
317 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.51 
 
 
379 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.51 
 
 
379 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.51 
 
 
348 aa  65.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  29.22 
 
 
387 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  29.22 
 
 
387 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.51 
 
 
348 aa  65.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  33.64 
 
 
396 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.51 
 
 
351 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  28.86 
 
 
407 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  29.87 
 
 
392 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  29.22 
 
 
392 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  34.44 
 
 
397 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  33.64 
 
 
391 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  36.3 
 
 
195 aa  64.3  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  36.3 
 
 
196 aa  64.3  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  33.64 
 
 
396 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  33.64 
 
 
391 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  32.98 
 
 
379 aa  63.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  34.22 
 
 
379 aa  63.5  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0648  polysaccharide export periplasmic protein  29.38 
 
 
270 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0639138  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  29.22 
 
 
392 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  31.55 
 
 
378 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  27.37 
 
 
247 aa  63.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  31.86 
 
 
185 aa  62.8  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0253  polysaccharide export protein  30.07 
 
 
367 aa  62.8  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.138137  decreased coverage  0.000559198 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  36.54 
 
 
372 aa  62.4  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  28.57 
 
 
270 aa  62.4  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  34.51 
 
 
264 aa  62  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0047  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.94 
 
 
429 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  35.04 
 
 
391 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0823  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.94 
 
 
429 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.94 
 
 
429 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  35.86 
 
 
392 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.94 
 
 
429 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.94 
 
 
429 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0609  polysaccharide export protein  28.37 
 
 
358 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.278241 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  28.97 
 
 
249 aa  61.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.94 
 
 
429 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  29.66 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.94 
 
 
429 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  32.43 
 
 
376 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.57 
 
 
446 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  31.98 
 
 
431 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.57 
 
 
400 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  38.94 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  30 
 
 
393 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.34 
 
 
429 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>