More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0460 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  358  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  52.67 
 
 
152 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  50 
 
 
153 aa  163  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  43.58 
 
 
178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  44.94 
 
 
178 aa  157  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  49.01 
 
 
177 aa  145  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  43.33 
 
 
184 aa  136  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  42.86 
 
 
177 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  40.88 
 
 
185 aa  132  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  37.36 
 
 
192 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  39.89 
 
 
177 aa  131  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  41.33 
 
 
221 aa  127  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  40.91 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  38.12 
 
 
185 aa  121  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  39.38 
 
 
195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  39.38 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  41.83 
 
 
216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  36.02 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  38.31 
 
 
234 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  38 
 
 
200 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  40 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  37.11 
 
 
196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  38.67 
 
 
187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  38.27 
 
 
235 aa  114  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  36.6 
 
 
238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  37.33 
 
 
189 aa  111  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  36 
 
 
219 aa  111  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  36.48 
 
 
235 aa  110  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  36.88 
 
 
196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  36 
 
 
220 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  34 
 
 
191 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
191 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  34.23 
 
 
247 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  35.9 
 
 
186 aa  103  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  33.55 
 
 
213 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  34.44 
 
 
196 aa  100  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  34 
 
 
191 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  42.61 
 
 
419 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  32.08 
 
 
192 aa  97.1  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  30.89 
 
 
264 aa  94.7  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  32.67 
 
 
192 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  32.67 
 
 
192 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  31.33 
 
 
195 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  32 
 
 
192 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  36.91 
 
 
427 aa  91.3  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  34 
 
 
190 aa  91.3  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  32.67 
 
 
190 aa  91.3  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  34.83 
 
 
193 aa  90.5  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  39.57 
 
 
426 aa  89.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  33.85 
 
 
324 aa  89.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  38.66 
 
 
205 aa  89.4  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  38.35 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  40.38 
 
 
439 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  33.89 
 
 
206 aa  82  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  34.56 
 
 
270 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  37.19 
 
 
422 aa  81.3  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  35.26 
 
 
378 aa  81.3  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  39.02 
 
 
384 aa  80.9  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  39.02 
 
 
454 aa  80.9  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4021  polysaccharide export protein  33.94 
 
 
451 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  38.46 
 
 
455 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  35.26 
 
 
386 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  38.46 
 
 
455 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  34.62 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  34.62 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  33.93 
 
 
451 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  34.62 
 
 
379 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  33.57 
 
 
410 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  34.62 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  33.57 
 
 
410 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  34.62 
 
 
386 aa  79.7  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  34.62 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  34.62 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  34.75 
 
 
411 aa  79  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  37.17 
 
 
268 aa  78.6  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  33.08 
 
 
417 aa  78.2  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  33.8 
 
 
459 aa  78.2  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  34.34 
 
 
377 aa  78.2  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1072  polysaccharide export protein  35.34 
 
 
423 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.660733  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  36.13 
 
 
435 aa  77.4  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  40.54 
 
 
277 aa  77  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5877  polysaccharide export protein  31.06 
 
 
425 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694613  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  37.5 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  36.94 
 
 
441 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  33.82 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  34.53 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  32.89 
 
 
461 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  32.59 
 
 
437 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  36.11 
 
 
816 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  30.77 
 
 
309 aa  75.1  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  36.97 
 
 
281 aa  74.7  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  34.34 
 
 
378 aa  75.1  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  34.34 
 
 
379 aa  74.7  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 
379 aa  74.7  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  31.4 
 
 
429 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 
379 aa  74.7  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 
351 aa  74.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 
348 aa  74.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 
348 aa  74.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.13 
 
 
379 aa  73.9  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>