252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5213 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  100 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  92.63 
 
 		 190 aa  351  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  75.26 
 
 		 195 aa  291  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  75.26 
 
 		 192 aa  290  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  74.21 
 
 		 192 aa  287  6e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  74.21 
 
 		 192 aa  287  6e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  46.41 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  52.55 
 
 		 196 aa  185  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  49.29 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  50 
 
 		 213 aa  177  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  57.43 
 
 		 247 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  57.24 
 
 		 238 aa  174  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  55.33 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  55.33 
 
 		 235 aa  170  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  54.67 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  48.65 
 
 		 187 aa  156  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  45.25 
 
 		 196 aa  155  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  45.25 
 
 		 195 aa  155  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  47.33 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  52 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  50 
 
 		 191 aa  147  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  44.09 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  44.09 
 
 		 191 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  49.33 
 
 		 189 aa  145  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  45.03 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  38.04 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  44.07 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  38.67 
 
 		 200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  45.1 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  45.03 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  37.33 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  34.62 
 
 		 193 aa  104  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  34.05 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  39.22 
 
 		 153 aa  102  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  32.97 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  31.35 
 
 		 185 aa  97.4  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  44.44 
 
 		 419 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  36.18 
 
 		 177 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  32.67 
 
 		 175 aa  91.3  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  32.1 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  33.13 
 
 		 178 aa  90.1  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  34 
 
 		 178 aa  89.4  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  32.7 
 
 		 205 aa  84.7  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  39.42 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  32.61 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  39.42 
 
 		 455 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  39.42 
 
 		 455 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  32.89 
 
 		 177 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  31.85 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  39.56 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  37.14 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  34.71 
 
 		 437 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  34.59 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  36.09 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  40.52 
 
 		 816 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  29.7 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  31.63 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  37.37 
 
 		 426 aa  68.9  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  38.46 
 
 		 417 aa  68.9  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  37.04 
 
 		 452 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  33.87 
 
 		 478 aa  67.4  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  34.25 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  31.03 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  35.45 
 
 		 459 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  28.65 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  35.71 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  31.61 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  28.79 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  29.45 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  27.53 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6217  polysaccharide export protein  36.96 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.166454 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6413  polysaccharide export protein  35.64 
 
 		 438 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  29.93 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  29.52 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  33.08 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  29.2 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.14 
 
 		 378 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  36.79 
 
 		 415 aa  62  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  35.34 
 
 		 415 aa  62  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  32.79 
 
 		 429 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  27.55 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  29.93 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  29.27 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  26.32 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  27.44 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  34.48 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  35.78 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  37.14 
 
 		 441 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  36.13 
 
 		 461 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1072  polysaccharide export protein  32.77 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.660733  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  35.25 
 
 		 410 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  28.43 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  35.54 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  33.62 
 
 		 365 aa  58.2  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  27.62 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  30.6 
 
 		 252 aa  57.8  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>