More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3242 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  100 
 
 		 212 aa  425  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  38.37 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  32.34 
 
 		 281 aa  90.5  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  34.21 
 
 		 264 aa  88.2  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  33.17 
 
 		 324 aa  85.5  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  32.53 
 
 		 344 aa  84.7  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  31.91 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  32.61 
 
 		 495 aa  81.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  31.77 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  30.88 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  25.52 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  31.52 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  29.35 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  30.23 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  32.18 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  27.62 
 
 		 277 aa  78.6  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1691  polysaccharide export protein  30 
 
 		 244 aa  78.2  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000171908  normal  0.0125517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  27.62 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  29.41 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  29.56 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  31.43 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  34.68 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  29.28 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  30.64 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  30.22 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  30.86 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  27.23 
 
 		 495 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  31.35 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0835  polysaccharide export protein  30.61 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  26.7 
 
 		 495 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  29.14 
 
 		 153 aa  70.9  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  31.11 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  30.23 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  26.51 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  27.66 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  30.18 
 
 		 454 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 384 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  27.08 
 
 		 473 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2488  polysaccharide export protein  31.91 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  26.67 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  27.88 
 
 		 417 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  28.5 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  31.21 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  30.52 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  30.89 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  28.12 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  30.81 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  28.71 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  28.41 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  25.7 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  28.11 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  26.42 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  26.26 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  26.45 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  26.09 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  27.43 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3716  polysaccharide export protein  28.24 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  26.92 
 
 		 869 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  25.23 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  26.32 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  25.6 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  26.59 
 
 		 347 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  28.11 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  31.55 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  28.43 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4021  polysaccharide export protein  36.63 
 
 		 451 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  28.75 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  29.73 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  35.45 
 
 		 451 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  28.11 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  28.02 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4285  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 255 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0419531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  29.59 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  26.06 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  28.04 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  28.83 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  24.89 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  26.74 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  26.06 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  25.47 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  27.53 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  29.48 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  29.48 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  26.74 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  30.64 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  24.43 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  27.68 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  28.9 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  29.14 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.69 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  26.79 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  29.35 
 
 		 358 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  27.85 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.06 
 
 		 429 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0609  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 358 aa  62.4  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.278241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  27.43 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  31.88 
 
 		 417 aa  62.4  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  24.02 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.45 
 
 		 429 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>