246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0024 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0024  polysaccharide export protein  100 
 
 		 1070 aa  2113    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00172785  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0660  polysaccharide export protein  43.25 
 
 		 823 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  30.27 
 
 		 992 aa  313  2e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  29.85 
 
 		 992 aa  297  7e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1613  polysaccharide export protein  24.05 
 
 		 830 aa  112  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  27.84 
 
 		 282 aa  75.9  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  29.31 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0830  capsular polysaccharide transport protein  24.88 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.738185  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  28.57 
 
 		 373 aa  72.8  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  29.51 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.32 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  25.23 
 
 		 378 aa  72  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  24.71 
 
 		 386 aa  70.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.44 
 
 		 378 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 264 aa  68.9  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  25.23 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  26.04 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  24.76 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  27.06 
 
 		 431 aa  67.8  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  24.12 
 
 		 377 aa  67.4  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  31.01 
 
 		 184 aa  67.4  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  23.11 
 
 		 952 aa  67.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  23.12 
 
 		 386 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  26.44 
 
 		 283 aa  66.6  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  22.54 
 
 		 379 aa  66.2  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  22.54 
 
 		 379 aa  66.2  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  22.54 
 
 		 379 aa  66.2  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  22.54 
 
 		 379 aa  66.2  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.28 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4429  polysaccharide export protein  23.53 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145769  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  34.65 
 
 		 195 aa  65.9  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  22.54 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  22.54 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.28 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.28 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  22.54 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  34.65 
 
 		 175 aa  65.9  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.28 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.28 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  34.65 
 
 		 196 aa  65.9  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  28.22 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  31.1 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  26.01 
 
 		 317 aa  63.9  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  26.63 
 
 		 381 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  23.12 
 
 		 379 aa  64.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1691  polysaccharide export protein  39.08 
 
 		 244 aa  63.9  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000171908  normal  0.0125517 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  23.7 
 
 		 379 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  23.7 
 
 		 379 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.7 
 
 		 379 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  33.66 
 
 		 196 aa  63.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  23.7 
 
 		 379 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.7 
 
 		 379 aa  63.5  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  23.7 
 
 		 379 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  25.67 
 
 		 268 aa  63.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.7 
 
 		 379 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.7 
 
 		 379 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  27.23 
 
 		 268 aa  62.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  27.75 
 
 		 270 aa  62.4  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  25.3 
 
 		 282 aa  62.4  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  35.64 
 
 		 187 aa  62.4  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4409  polysaccharide export protein  25.88 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  25.84 
 
 		 376 aa  62  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  27.66 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.82 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.82 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.82 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  24.14 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  30.83 
 
 		 392 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2864  polysaccharide export protein  25.22 
 
 		 389 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  20.81 
 
 		 833 aa  60.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  30.83 
 
 		 397 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  23.24 
 
 		 391 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4086  polysaccharide export protein  26.97 
 
 		 360 aa  60.1  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.194923  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3833  polysaccharide export protein  21.26 
 
 		 371 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.679596  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  23.46 
 
 		 391 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  30.08 
 
 		 392 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  23.24 
 
 		 385 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  30.08 
 
 		 387 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  30.08 
 
 		 387 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4430  polysaccharide export protein  25.29 
 
 		 368 aa  60.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.756533  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  24.42 
 
 		 356 aa  59.7  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  25.86 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  29.63 
 
 		 178 aa  59.7  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4275  polysaccharide export protein  24.71 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  32.58 
 
 		 153 aa  59.3  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  30.18 
 
 		 270 aa  59.3  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.82 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2478  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  26.27 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  25.3 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  29.07 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  29.59 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  23.53 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.82 
 
 		 391 aa  57.4  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.82 
 
 		 391 aa  57.4  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.82 
 
 		 396 aa  57.4  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  24.18 
 
 		 396 aa  57.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  26.6 
 
 		 185 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  29.32 
 
 		 392 aa  57.4  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  29.32 
 
 		 392 aa  57.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>