More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0647 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0647  polysaccharide export system, outer membrane component  100 
 
 		 358 aa  720    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428631 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0609  polysaccharide export protein  77.99 
 
 		 358 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.278241 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0253  polysaccharide export protein  55.87 
 
 		 367 aa  420  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.138137  decreased coverage  0.000559198 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  30.79 
 
 		 391 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  32.34 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.39 
 
 		 400 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.39 
 
 		 446 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.04 
 
 		 422 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  32.51 
 
 		 350 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  32.14 
 
 		 384 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  28.98 
 
 		 379 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  31.4 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  32.87 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  31.58 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  31.1 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4429  polysaccharide export protein  28.41 
 
 		 374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  30.74 
 
 		 391 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  32.16 
 
 		 348 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  34.27 
 
 		 379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  28.99 
 
 		 379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  28.99 
 
 		 379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.99 
 
 		 379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  28.99 
 
 		 379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.99 
 
 		 379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.99 
 
 		 379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  28.99 
 
 		 379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.99 
 
 		 379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  27.64 
 
 		 372 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  30.74 
 
 		 391 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  30.74 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1817  polysaccharide export protein  31.8 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.538171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  28.41 
 
 		 377 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  31.35 
 
 		 417 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  29.97 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  29.97 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.73 
 
 		 378 aa  160  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  29.97 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  30.08 
 
 		 386 aa  160  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  29.97 
 
 		 386 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  29.97 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  31.82 
 
 		 398 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  29.7 
 
 		 386 aa  160  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6263  polysaccharide export protein  32.55 
 
 		 385 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.46 
 
 		 379 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30130  Polysaccharide export protein  30.6 
 
 		 379 aa  160  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.46 
 
 		 379 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  30.53 
 
 		 392 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  32.16 
 
 		 348 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  29.7 
 
 		 379 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6483  polysaccharide export protein  30.96 
 
 		 426 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1118  polysaccharide export protein  30.85 
 
 		 426 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  27.62 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.85 
 
 		 351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3833  polysaccharide export protein  30 
 
 		 371 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.679596  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4275  polysaccharide export protein  27.25 
 
 		 368 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4409  polysaccharide export protein  27.25 
 
 		 368 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.85 
 
 		 348 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.85 
 
 		 348 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4430  polysaccharide export protein  27.25 
 
 		 368 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.756533  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  28.19 
 
 		 379 aa  155  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3319  polysaccharide export protein  30.85 
 
 		 383 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00116836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  30.85 
 
 		 423 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  30.85 
 
 		 423 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  32.27 
 
 		 417 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3621  polysaccharide export protein  30.39 
 
 		 408 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.816168 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3232  polysaccharide export protein  29.4 
 
 		 362 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.549213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  28 
 
 		 373 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4096  polysaccharide export protein  30.39 
 
 		 407 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  30.2 
 
 		 391 aa  152  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  29.47 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  29.82 
 
 		 317 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  30.36 
 
 		 362 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  29.53 
 
 		 390 aa  149  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1583  polysaccharide export protein  29.97 
 
 		 378 aa  149  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.323182  normal  0.546592 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  26.27 
 
 		 378 aa  149  9e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  27.06 
 
 		 378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  31.03 
 
 		 381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3450  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.45 
 
 		 364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  28.93 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  31.14 
 
 		 393 aa  146  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2864  polysaccharide export protein  30.82 
 
 		 389 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6745  polysaccharide export protein  28.78 
 
 		 369 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  28.73 
 
 		 431 aa  146  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.12 
 
 		 396 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.34 
 
 		 375 aa  145  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  27.2 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.83 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.83 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.83 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  26.94 
 
 		 378 aa  142  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5118  polysaccharide export protein  30.39 
 
 		 348 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  normal  0.024948 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1690  polysaccharide export protein  29.65 
 
 		 428 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.977677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  31.56 
 
 		 397 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  28.71 
 
 		 393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  27.81 
 
 		 392 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  27.81 
 
 		 387 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  27.81 
 
 		 387 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  27.48 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  27.48 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  26.94 
 
 		 356 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>