133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1307 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  100 
 
 		 565 aa  1122    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  45.2 
 
 		 587 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  45.21 
 
 		 579 aa  442  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  46.4 
 
 		 605 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  45.53 
 
 		 557 aa  423  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  43.52 
 
 		 537 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  44.13 
 
 		 558 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  44.31 
 
 		 606 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  41.8 
 
 		 609 aa  405  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  42.45 
 
 		 516 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  40.39 
 
 		 558 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  40.39 
 
 		 558 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  40.39 
 
 		 558 aa  388  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  40.12 
 
 		 552 aa  375  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  39.08 
 
 		 552 aa  370  1e-101  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  38.55 
 
 		 552 aa  372  1e-101  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  39.39 
 
 		 552 aa  370  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  41.68 
 
 		 603 aa  355  8.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  37.45 
 
 		 606 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  25.24 
 
 		 576 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  25.53 
 
 		 849 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.54 
 
 		 877 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.09 
 
 		 877 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  27.09 
 
 		 875 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  33.48 
 
 		 834 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  26.87 
 
 		 800 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  25.6 
 
 		 948 aa  115  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  32.92 
 
 		 947 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  33.83 
 
 		 833 aa  110  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  26.74 
 
 		 779 aa  109  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  28.5 
 
 		 753 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  34.74 
 
 		 869 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  27.09 
 
 		 803 aa  104  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  34.83 
 
 		 952 aa  104  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  37.99 
 
 		 940 aa  101  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  33.88 
 
 		 936 aa  100  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  24.87 
 
 		 977 aa  97.8  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  32.97 
 
 		 824 aa  96.7  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  29.9 
 
 		 781 aa  93.2  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.43 
 
 		 920 aa  91.7  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  29.06 
 
 		 920 aa  89.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  31.69 
 
 		 912 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  27.76 
 
 		 869 aa  87.8  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  28.99 
 
 		 915 aa  87.4  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  28.76 
 
 		 1055 aa  87  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  28.04 
 
 		 922 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  26.88 
 
 		 897 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  27.1 
 
 		 919 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  25 
 
 		 869 aa  84  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  28.08 
 
 		 921 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  28.02 
 
 		 931 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  26.17 
 
 		 910 aa  82  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  30.42 
 
 		 827 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  27.44 
 
 		 852 aa  80.5  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  29.12 
 
 		 830 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 828 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  27.8 
 
 		 919 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  29.81 
 
 		 846 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  23.6 
 
 		 830 aa  76.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  28.86 
 
 		 828 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  24.68 
 
 		 580 aa  75.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  25.23 
 
 		 478 aa  73.2  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  26.54 
 
 		 833 aa  71.6  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  29.79 
 
 		 823 aa  71.2  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  32.93 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  26.45 
 
 		 837 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  26.45 
 
 		 837 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  25.82 
 
 		 800 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  22.59 
 
 		 791 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  28.24 
 
 		 828 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  29.45 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  29.45 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  26.03 
 
 		 837 aa  63.5  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0827  polysaccharide export protein  36.88 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.895511  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  29.94 
 
 		 700 aa  62.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  26.7 
 
 		 812 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.17 
 
 		 703 aa  61.6  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  26.7 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  23.71 
 
 		 568 aa  60.5  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  24.73 
 
 		 700 aa  60.1  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  27.38 
 
 		 205 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  27.93 
 
 		 277 aa  56.2  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  27.67 
 
 		 425 aa  55.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  28.72 
 
 		 992 aa  55.5  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  31.73 
 
 		 213 aa  53.9  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0024  polysaccharide export protein  21.21 
 
 		 1070 aa  53.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00172785  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  23.26 
 
 		 317 aa  52.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  30.64 
 
 		 196 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  30.3 
 
 		 234 aa  51.2  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  31.31 
 
 		 235 aa  51.2  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  28.14 
 
 		 417 aa  51.2  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  25.73 
 
 		 387 aa  50.4  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  25.27 
 
 		 268 aa  50.4  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  27.43 
 
 		 362 aa  50.4  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2210  polysaccharide export outer membrane protein  27.57 
 
 		 357 aa  50.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 419 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  24.85 
 
 		 243 aa  49.3  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  30.3 
 
 		 235 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4021  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 451 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>