283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1964 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1964  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 529 aa  1055    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.94592  normal  0.207837 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2689  preprotein translocase subunit SecD  48.38 
 
 		 510 aa  432  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0744  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  46.69 
 
 		 537 aa  423  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2707  preprotein translocase subunit SecD  47.62 
 
 		 549 aa  418  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1322  preprotein translocase subunit SecD  45.42 
 
 		 546 aa  401  9.999999999999999e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.776168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1023  preprotein translocase subunit SecD  34.33 
 
 		 507 aa  225  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3176  preprotein translocase subunit SecD  32.2 
 
 		 484 aa  225  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1656  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 485 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00710078  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1797  preprotein translocase subunit SecD  34.48 
 
 		 486 aa  209  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0601908  normal  0.730674 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0280  preprotein translocase subunit SecD  35.02 
 
 		 497 aa  195  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0851  preprotein translocase subunit SecD  28.98 
 
 		 566 aa  189  8e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0895  preprotein translocase subunit SecD  33.09 
 
 		 558 aa  171  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.433485  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0836  preprotein translocase subunit SecD  41.2 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1017  preprotein translocase subunit SecD  35 
 
 		 391 aa  156  7e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.562711  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0771  preprotein translocase subunit SecD  40.77 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1147  preprotein translocase subunit SecD  40.77 
 
 		 388 aa  152  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0052  preprotein translocase subunit SecD  40.34 
 
 		 388 aa  150  7e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1987  preprotein translocase subunit SecD  35.03 
 
 		 564 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000381338  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  25.97 
 
 		 534 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  24.86 
 
 		 531 aa  76.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  26.54 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  26.27 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  25.87 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  31.86 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  24.65 
 
 		 525 aa  73.9  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  31.46 
 
 		 735 aa  73.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  24.26 
 
 		 533 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1340  protein-export membrane protein SecD  34.44 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  25 
 
 		 468 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  23.81 
 
 		 532 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  24.82 
 
 		 532 aa  71.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  23.97 
 
 		 534 aa  70.1  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  24.68 
 
 		 533 aa  70.1  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  26.03 
 
 		 410 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  33.16 
 
 		 471 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  24.77 
 
 		 554 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  30.94 
 
 		 474 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  30.34 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  32.73 
 
 		 470 aa  69.3  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  31.38 
 
 		 495 aa  68.2  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  28.16 
 
 		 493 aa  68.2  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  25.53 
 
 		 532 aa  68.6  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  24.66 
 
 		 474 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.37 
 
 		 848 aa  67.8  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  26.88 
 
 		 423 aa  67  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  25 
 
 		 489 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  23.32 
 
 		 533 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  24.3 
 
 		 534 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  23.08 
 
 		 532 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  24.28 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  25.46 
 
 		 534 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0067  protein-export membrane protein SecD  25.3 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  28.78 
 
 		 605 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  27.69 
 
 		 594 aa  64.3  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  26.21 
 
 		 533 aa  64.3  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  29.15 
 
 		 638 aa  63.9  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0067  protein-export membrane protein SecD  34.02 
 
 		 465 aa  63.9  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  25.31 
 
 		 464 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  26.59 
 
 		 533 aa  63.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  28.72 
 
 		 530 aa  63.5  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  24.3 
 
 		 533 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  25.85 
 
 		 843 aa  63.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  23.92 
 
 		 533 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0146  protein-export membrane protein SecD  23.03 
 
 		 535 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00836416  hitchhiker  0.00269224 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  30.98 
 
 		 594 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.12 
 
 		 856 aa  62.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  30.98 
 
 		 594 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.04 
 
 		 849 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  30.58 
 
 		 503 aa  62.4  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1073  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.29 
 
 		 753 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0361267  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3051  protein-export membrane protein SecD  30.96 
 
 		 684 aa  62  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  24.25 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1373  preprotein translocase subunit SecD  31.39 
 
 		 607 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  29.32 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  30.61 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  30.61 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0504  protein-export membrane protein SecD  27.82 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000522922  hitchhiker  0.000170526 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  28.22 
 
 		 532 aa  60.5  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  26.82 
 
 		 554 aa  60.5  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  26.73 
 
 		 613 aa  60.1  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  26.73 
 
 		 613 aa  60.1  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  24.8 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  28.72 
 
 		 530 aa  60.1  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  26.73 
 
 		 613 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  29.44 
 
 		 496 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  24.8 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3174  protein-export membrane protein SecD  25.86 
 
 		 566 aa  60.1  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.761403  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  29.26 
 
 		 531 aa  59.3  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1905  protein-export membrane protein SecD  30.89 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15100  protein-export membrane protein SecD  27.04 
 
 		 603 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  29.44 
 
 		 496 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  22.19 
 
 		 533 aa  58.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5142  preprotein translocase subunit SecD  31.46 
 
 		 680 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75892  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  30.3 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000019832  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  31.03 
 
 		 533 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.29 
 
 		 759 aa  58.2  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  27.62 
 
 		 535 aa  58.2  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  30.21 
 
 		 531 aa  57.8  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  23.64 
 
 		 532 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  27.8 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>