More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1309 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  100 
 
 		 153 aa  301  3.0000000000000004e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  70.95 
 
 		 155 aa  219  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  66.89 
 
 		 156 aa  197  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  60.14 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  48.3 
 
 		 144 aa  113  7.999999999999999e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  46.94 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  43.54 
 
 		 290 aa  110  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  42.86 
 
 		 288 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  41.18 
 
 		 148 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  44.59 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  42.68 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  42.18 
 
 		 208 aa  103  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  38.1 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  39.47 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  42.18 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  43.05 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  43.24 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  43.92 
 
 		 159 aa  99.4  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  42.18 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  42.33 
 
 		 169 aa  99  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  42.95 
 
 		 297 aa  97.4  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  41.72 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  40 
 
 		 307 aa  95.5  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 		 145 aa  96.3  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  39.87 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  36 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  38.16 
 
 		 286 aa  95.1  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  42.18 
 
 		 158 aa  94.4  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  40.27 
 
 		 301 aa  94  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  39.16 
 
 		 305 aa  93.6  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  41.22 
 
 		 281 aa  92.8  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  39.35 
 
 		 167 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 		 145 aa  92  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  39.61 
 
 		 144 aa  92  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  41.1 
 
 		 287 aa  91.3  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  36.11 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  42.86 
 
 		 141 aa  90.9  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  35.21 
 
 		 165 aa  90.5  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  39.73 
 
 		 301 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  38.78 
 
 		 300 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  40.91 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  38.93 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  38.1 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  38.46 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  35.81 
 
 		 145 aa  87.4  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  38.1 
 
 		 136 aa  87.4  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.76 
 
 		 147 aa  87  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  41.78 
 
 		 280 aa  87  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  39.22 
 
 		 167 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  38.75 
 
 		 415 aa  85.9  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  36.54 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  40.52 
 
 		 163 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  37.91 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  39.19 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  38.1 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  35.76 
 
 		 151 aa  84.7  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  38 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  34.21 
 
 		 149 aa  84.3  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  41.5 
 
 		 283 aa  83.6  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4249  UspA domain protein  36.91 
 
 		 133 aa  83.6  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  37.67 
 
 		 159 aa  83.6  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  39.2 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  36.77 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  36.18 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  37.82 
 
 		 139 aa  83.6  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  41.22 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  35.29 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  34.69 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  36.49 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  35.29 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  36.67 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  40.27 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  34.69 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 274 aa  80.9  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  38.1 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16290  universal stress protein UspA-like protein  31.41 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000127865  hitchhiker  0.0000372029 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  34.67 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  37.42 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  41.89 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  37.67 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  34.01 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  40.25 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  34.01 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  40.4 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  34.01 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  34.01 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  36.18 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  38.51 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  34.01 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  34.01 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1541  hypothetical protein  32.24 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>