More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0606 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0606  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
785 aa  1612    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  51.03 
 
 
998 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
763 aa  262  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  49.81 
 
 
970 aa  258  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  51.15 
 
 
858 aa  258  4e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  54.07 
 
 
927 aa  257  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0615  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
395 aa  254  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 
641 aa  253  9.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  52.96 
 
 
575 aa  252  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.39 
 
 
574 aa  252  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  51.52 
 
 
791 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.76 
 
 
386 aa  244  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000238922  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  51.2 
 
 
910 aa  243  7e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.77 
 
 
917 aa  241  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  50.41 
 
 
977 aa  239  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.67 
 
 
569 aa  239  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0148365  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.88 
 
 
1022 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.76 
 
 
631 aa  233  8.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.98 
 
 
984 aa  228  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.58 
 
 
796 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 
823 aa  222  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.72 
 
 
699 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
792 aa  218  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2746  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.78 
 
 
596 aa  217  7e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.313231  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  32.96 
 
 
1653 aa  216  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1975  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.28 
 
 
633 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.88 
 
 
798 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.19 
 
 
1003 aa  215  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  43.57 
 
 
810 aa  214  5.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 
803 aa  210  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  50 
 
 
792 aa  210  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1346  PAS sensor protein  47.17 
 
 
803 aa  208  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.56 
 
 
991 aa  208  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  45.78 
 
 
823 aa  207  5e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
1877 aa  207  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3611  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.79 
 
 
577 aa  206  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 
579 aa  204  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3020  histidine kinase  45.73 
 
 
631 aa  204  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000249854  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  44.22 
 
 
659 aa  202  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 
616 aa  203  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.315862  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.35 
 
 
1768 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.67 
 
 
995 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 
1550 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.96 
 
 
1765 aa  201  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.96 
 
 
1267 aa  200  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  45.71 
 
 
853 aa  200  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.37 
 
 
2213 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  41.12 
 
 
1765 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.39 
 
 
1135 aa  198  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.4 
 
 
1767 aa  196  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.82 
 
 
1611 aa  196  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  44.86 
 
 
1053 aa  195  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.54 
 
 
1165 aa  195  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.03 
 
 
882 aa  196  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.27 
 
 
1771 aa  196  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 
1326 aa  196  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  45.82 
 
 
1023 aa  195  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.13 
 
 
1767 aa  195  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.13 
 
 
1767 aa  195  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3379  histidine kinase  44.03 
 
 
626 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.52 
 
 
817 aa  194  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2724  histidine kinase  44.03 
 
 
626 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 
1034 aa  194  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  45.19 
 
 
777 aa  194  7e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
1350 aa  194  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4481  sensor histidine kinase/response regulator  42.16 
 
 
982 aa  193  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 
974 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.94 
 
 
1313 aa  193  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.26 
 
 
827 aa  192  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 
767 aa  192  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.59 
 
 
1410 aa  192  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
617 aa  192  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  46.69 
 
 
1763 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.83 
 
 
940 aa  191  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1767  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.46 
 
 
1157 aa  191  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.64 
 
 
1959 aa  191  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.41 
 
 
846 aa  191  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.37 
 
 
1927 aa  191  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 
827 aa  191  5.999999999999999e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 
557 aa  190  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.125124  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.19 
 
 
1792 aa  190  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.66 
 
 
1322 aa  190  9e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.24 
 
 
876 aa  190  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  44.26 
 
 
1331 aa  189  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000354  sensor histidine kinase  38.08 
 
 
785 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.407699  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.02 
 
 
932 aa  189  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.06 
 
 
1548 aa  190  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.91 
 
 
1177 aa  189  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.02 
 
 
743 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.7 
 
 
1199 aa  189  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.85 
 
 
1784 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  43.15 
 
 
794 aa  189  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.51 
 
 
975 aa  189  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  43.25 
 
 
661 aa  189  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.85 
 
 
1786 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.44 
 
 
1340 aa  189  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.9 
 
 
781 aa  189  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.9 
 
 
1260 aa  189  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0298  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
899 aa  189  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0542846  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.85 
 
 
1782 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>