105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0762 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  100 
 
 		 1439 aa  2734    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  53.16 
 
 		 1141 aa  460  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  56.3 
 
 		 916 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  53.79 
 
 		 1496 aa  287  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  33.72 
 
 		 1526 aa  218  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  42.34 
 
 		 2042 aa  208  6e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  38.94 
 
 		 1588 aa  191  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  37.76 
 
 		 1585 aa  186  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  39.91 
 
 		 675 aa  179  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  55.68 
 
 		 777 aa  176  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.53 
 
 		 3589 aa  164  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.98 
 
 		 4500 aa  155  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.8 
 
 		 4855 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.76 
 
 		 2744 aa  143  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  31.42 
 
 		 2716 aa  127  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  35.43 
 
 		 1096 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  46.67 
 
 		 2802 aa  116  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  37.5 
 
 		 1275 aa  112  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  40.64 
 
 		 2636 aa  110  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  37.79 
 
 		 1537 aa  110  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  38.81 
 
 		 1538 aa  110  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  34.04 
 
 		 2927 aa  109  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  37.22 
 
 		 499 aa  108  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1994 aa  107  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  38.49 
 
 		 549 aa  103  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  37.2 
 
 		 1047 aa  102  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  49.11 
 
 		 1241 aa  101  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  38.48 
 
 		 827 aa  101  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  49.59 
 
 		 1830 aa  97.8  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.301903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  27.21 
 
 		 2271 aa  96.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  53.08 
 
 		 2178 aa  94.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  35.77 
 
 		 482 aa  91.7  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3562  filamentous hemeagglutinin outer membrane protein  56.99 
 
 		 577 aa  90.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  45 
 
 		 2002 aa  89  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  32.83 
 
 		 2296 aa  88.6  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  56.52 
 
 		 1779 aa  87  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  32.74 
 
 		 2522 aa  86.7  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  31.82 
 
 		 2042 aa  79.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  41.32 
 
 		 331 aa  79.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  45.87 
 
 		 534 aa  77.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  40.55 
 
 		 2192 aa  76.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  41.08 
 
 		 1848 aa  76.3  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  33.33 
 
 		 2476 aa  75.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  35.23 
 
 		 1804 aa  72.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1428  hypothetical protein  48.42 
 
 		 794 aa  72  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1660  hypothetical protein  47.5 
 
 		 336 aa  69.3  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  57.38 
 
 		 1869 aa  68.6  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  35.92 
 
 		 913 aa  68.6  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  34.62 
 
 		 2170 aa  68.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  33.33 
 
 		 2262 aa  67.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  30.46 
 
 		 4430 aa  67.8  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  34 
 
 		 1219 aa  67  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  45.1 
 
 		 1371 aa  65.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0969  hypothetical protein  45.83 
 
 		 340 aa  64.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.829074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  28.5 
 
 		 898 aa  63.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  30.44 
 
 		 2704 aa  64.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.03 
 
 		 5613 aa  63.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  33.94 
 
 		 3544 aa  62.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  28.54 
 
 		 899 aa  62.4  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  39.39 
 
 		 888 aa  61.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  31 
 
 		 4106 aa  61.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  41.44 
 
 		 3089 aa  61.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  40.21 
 
 		 906 aa  61.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5474  hypothetical protein  40.62 
 
 		 780 aa  60.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.769605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  32.09 
 
 		 1999 aa  60.1  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  26.53 
 
 		 3920 aa  57.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  30.19 
 
 		 1152 aa  55.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.93 
 
 		 626 aa  55.1  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1583  cytochrome c, class I  46.58 
 
 		 475 aa  55.1  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000740916  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.23 
 
 		 3699 aa  55.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  28.35 
 
 		 5561 aa  54.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  28.35 
 
 		 5561 aa  54.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0104  cell wall/surface repeat protein  25.81 
 
 		 2099 aa  55.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  31.46 
 
 		 2503 aa  54.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  31.44 
 
 		 3824 aa  54.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0970  hypothetical protein  40 
 
 		 983 aa  53.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.351823  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  30.95 
 
 		 3824 aa  53.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03190  hypothetical protein  28.17 
 
 		 2400 aa  53.5  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427752 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1888  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.52 
 
 		 626 aa  52.8  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67203  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2098  hypothetical protein  37.5 
 
 		 373 aa  52.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  31.27 
 
 		 3739 aa  52.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  30.33 
 
 		 3824 aa  51.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  25.57 
 
 		 5561 aa  51.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  34.75 
 
 		 1657 aa  50.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1796  Fibronectin type III domain protein  28.62 
 
 		 694 aa  50.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303311  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2918  hypothetical protein  33.47 
 
 		 714 aa  49.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1061 aa  49.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  30.77 
 
 		 3721 aa  48.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  35.79 
 
 		 937 aa  48.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  24.81 
 
 		 820 aa  48.5  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  29.71 
 
 		 2456 aa  48.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  25.12 
 
 		 1902 aa  48.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  29.65 
 
 		 680 aa  47.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  29.69 
 
 		 2625 aa  47.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3336  Glycosidase-like protein  40.44 
 
 		 997 aa  47.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.310456  normal  0.29304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0492  peptidase M36 fungalysin  33.72 
 
 		 1147 aa  47.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.921805 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1149  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.82 
 
 		 2217 aa  47  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  29.48 
 
 		 831 aa  46.6  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  29.79 
 
 		 1428 aa  46.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  27.44 
 
 		 5559 aa  46.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>