More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0089 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0089  beta-lactamase  100 
 
 		 401 aa  817    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3905  beta-lactamase  68.46 
 
 		 397 aa  564  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2284  hypothetical protein  71.76 
 
 		 395 aa  554  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2901  beta-lactamase  62.56 
 
 		 760 aa  491  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453349  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3549  beta-lactamase  60.05 
 
 		 400 aa  480  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2104  beta-lactamase  58.21 
 
 		 396 aa  464  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1441  putative 1,4-butanediol diacrylate esterase  53.16 
 
 		 395 aa  420  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00263583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0394  putative 1,4-butanediol diacrylate esterase  52.62 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  48.63 
 
 		 395 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2728  beta-lactamase  51.56 
 
 		 387 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.144324 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  48.52 
 
 		 395 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2556  beta-lactamase  51.29 
 
 		 395 aa  360  3e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  51.53 
 
 		 389 aa  352  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  45.24 
 
 		 395 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  45.18 
 
 		 419 aa  342  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3473  beta-lactamase  47.47 
 
 		 392 aa  335  9e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  44.2 
 
 		 395 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0035  putative beta-lactamase  45.55 
 
 		 397 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  42.97 
 
 		 437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1072  beta-lactamase  44.76 
 
 		 410 aa  298  9e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3462  beta-lactamase  40.15 
 
 		 406 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00219099  normal  0.0121501 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44235  predicted protein  36.99 
 
 		 397 aa  250  4e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88817  1,4-butanediol diacrylate esterase  36.97 
 
 		 418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.642668 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05422  beta-lactamase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07500)  35.9 
 
 		 415 aa  218  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300599  normal  0.931508 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  30.99 
 
 		 419 aa  177  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  30.97 
 
 		 438 aa  159  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  30.7 
 
 		 402 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  32.36 
 
 		 433 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  30.81 
 
 		 414 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  29.95 
 
 		 408 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  30 
 
 		 411 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  32.66 
 
 		 454 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  26.77 
 
 		 377 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  30.26 
 
 		 411 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  32.06 
 
 		 409 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09049  transesterase (LovD), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00920)  30.34 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  31.18 
 
 		 447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  28.61 
 
 		 422 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  30.6 
 
 		 414 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  29.12 
 
 		 420 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  31.71 
 
 		 613 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  30.15 
 
 		 407 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  30.6 
 
 		 424 aa  144  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  29.59 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  29.26 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  29.7 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  28.91 
 
 		 406 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  28.97 
 
 		 408 aa  139  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  28.21 
 
 		 382 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  32.27 
 
 		 424 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  32.62 
 
 		 436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  28.94 
 
 		 420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  28.12 
 
 		 405 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  28.24 
 
 		 370 aa  136  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  36.65 
 
 		 427 aa  135  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  29.07 
 
 		 418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  28.27 
 
 		 414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  30.15 
 
 		 426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  27.34 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  32.2 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  28.5 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  29.68 
 
 		 420 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  30.41 
 
 		 407 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  29.68 
 
 		 420 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  28.32 
 
 		 424 aa  133  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  30.77 
 
 		 407 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  30.03 
 
 		 412 aa  133  5e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  28.39 
 
 		 427 aa  132  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  29.41 
 
 		 430 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  31.5 
 
 		 440 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  28.37 
 
 		 405 aa  131  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  30.11 
 
 		 425 aa  129  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  30.85 
 
 		 437 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  29.95 
 
 		 407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2265  twin-arginine translocation pathway signal  28.09 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  28.37 
 
 		 411 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  29.13 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  32.08 
 
 		 401 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  32.08 
 
 		 401 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  32.08 
 
 		 401 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  32.75 
 
 		 422 aa  126  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  31.67 
 
 		 401 aa  126  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  35.14 
 
 		 401 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  33.22 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  27.76 
 
 		 431 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  29.93 
 
 		 399 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  29.74 
 
 		 410 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  27.18 
 
 		 426 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  29.02 
 
 		 409 aa  123  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  27.88 
 
 		 440 aa  122  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  30 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  28.03 
 
 		 407 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  28.09 
 
 		 444 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2251  beta-lactamase  30.49 
 
 		 432 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  29.87 
 
 		 415 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  27.75 
 
 		 430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  32.23 
 
 		 423 aa  116  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  28.06 
 
 		 468 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  28.95 
 
 		 418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  33.46 
 
 		 431 aa  113  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>