255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0745 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  69.74 
 
 		 859 aa  1180    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  65.11 
 
 		 871 aa  1126    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  61.77 
 
 		 838 aa  984    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  67.62 
 
 		 857 aa  1169    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  66.67 
 
 		 836 aa  1115    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  67.85 
 
 		 872 aa  1177    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  100 
 
 		 899 aa  1788    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  46.73 
 
 		 820 aa  680    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  79.79 
 
 		 944 aa  1415    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  65.91 
 
 		 875 aa  1137    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  65.77 
 
 		 859 aa  1123    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  50.76 
 
 		 779 aa  691    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  67.12 
 
 		 881 aa  1134    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  68.2 
 
 		 884 aa  1108    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  64.35 
 
 		 842 aa  1122    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  67.74 
 
 		 852 aa  1168    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  65.62 
 
 		 841 aa  1114    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  65.77 
 
 		 859 aa  1123    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  65.97 
 
 		 859 aa  1097    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  65.62 
 
 		 863 aa  1117    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  49.71 
 
 		 811 aa  709    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  65.4 
 
 		 856 aa  1089    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  48.66 
 
 		 826 aa  685    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  65.77 
 
 		 859 aa  1123    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  66.47 
 
 		 859 aa  1105    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  65.29 
 
 		 867 aa  1145    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  64.56 
 
 		 860 aa  1072    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  41.97 
 
 		 841 aa  580  1e-164  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  45.99 
 
 		 757 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  61.48 
 
 		 416 aa  491  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  62.69 
 
 		 430 aa  463  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  55.82 
 
 		 800 aa  384  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  51.86 
 
 		 792 aa  379  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  47.76 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  53.22 
 
 		 435 aa  363  6e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  47.83 
 
 		 418 aa  347  5e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  44.92 
 
 		 392 aa  334  4e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  42.51 
 
 		 419 aa  314  3.9999999999999997e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  42.41 
 
 		 359 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  43.27 
 
 		 370 aa  313  7.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  41.97 
 
 		 362 aa  313  1e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  42.98 
 
 		 359 aa  312  2e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  48.06 
 
 		 380 aa  308  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  47.58 
 
 		 376 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  45.77 
 
 		 453 aa  304  4.0000000000000003e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  46.93 
 
 		 386 aa  301  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  40.11 
 
 		 359 aa  301  3e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  43.21 
 
 		 367 aa  295  2e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  50.16 
 
 		 419 aa  292  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  45.95 
 
 		 381 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  45.26 
 
 		 358 aa  288  4e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  43.05 
 
 		 365 aa  283  7.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.14 
 
 		 382 aa  283  8.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  43.08 
 
 		 352 aa  283  1e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  44.09 
 
 		 356 aa  282  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  42.09 
 
 		 352 aa  282  2e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  42.2 
 
 		 737 aa  281  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  41.55 
 
 		 366 aa  280  9e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  44.7 
 
 		 741 aa  278  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  42.57 
 
 		 362 aa  279  2e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  39.03 
 
 		 358 aa  278  5e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  44.41 
 
 		 737 aa  277  7e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  41.23 
 
 		 380 aa  276  9e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1054  FO synthase subunit 2  40.11 
 
 		 358 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3326  FO synthase  43.37 
 
 		 372 aa  275  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.9768  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  42.15 
 
 		 352 aa  275  4.0000000000000004e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  42.7 
 
 		 391 aa  274  6e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  38.76 
 
 		 390 aa  272  2e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  43.55 
 
 		 565 aa  269  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1620  FO synthase subunit 2  40.11 
 
 		 358 aa  269  2e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  42.06 
 
 		 351 aa  266  1e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  41.01 
 
 		 376 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  40.11 
 
 		 384 aa  265  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  40 
 
 		 384 aa  264  6e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  40.11 
 
 		 384 aa  263  8e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  42.9 
 
 		 329 aa  263  1e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  42 
 
 		 398 aa  262  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  45.97 
 
 		 331 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  41.74 
 
 		 325 aa  258  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  37.88 
 
 		 356 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  40.52 
 
 		 362 aa  253  8.000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  44.11 
 
 		 327 aa  251  6e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0686  FO synthase subunit 2  42.09 
 
 		 386 aa  250  7e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  38.48 
 
 		 364 aa  248  4.9999999999999997e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  43.81 
 
 		 321 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  37.9 
 
 		 362 aa  247  6e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  43.44 
 
 		 368 aa  242  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  47.28 
 
 		 387 aa  241  5.999999999999999e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  39.76 
 
 		 330 aa  238  5.0000000000000005e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  42.65 
 
 		 389 aa  237  9e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  39.14 
 
 		 367 aa  235  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  40.73 
 
 		 368 aa  234  6e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  39.09 
 
 		 371 aa  233  9e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  36.73 
 
 		 361 aa  233  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  41.9 
 
 		 393 aa  233  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  39.72 
 
 		 361 aa  232  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  38.87 
 
 		 360 aa  232  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  39.35 
 
 		 358 aa  231  7e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3629  conserved hypothetical protein; putative SAM domain  45.09 
 
 		 339 aa  229  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0222869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  37.46 
 
 		 360 aa  229  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>