More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1487 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  100 
 
 
164 aa  337  4e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.6 
 
 
161 aa  110  9e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.22 
 
 
167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 
163 aa  104  7e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.95 
 
 
156 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.16 
 
 
171 aa  102  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.02 
 
 
169 aa  100  6e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.42 
 
 
167 aa  100  7e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.67 
 
 
156 aa  99  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.43 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  40.23 
 
 
163 aa  96.3  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.37 
 
 
147 aa  96.3  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  44.16 
 
 
158 aa  95.9  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.62 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.02 
 
 
152 aa  94.4  7e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.36 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.74 
 
 
175 aa  93.6  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.86 
 
 
179 aa  93.2  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44 
 
 
151 aa  93.2  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  37.57 
 
 
168 aa  92.8  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.79 
 
 
158 aa  92.8  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  41.98 
 
 
171 aa  92  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.67 
 
 
167 aa  91.7  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.1 
 
 
165 aa  91.7  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  41.18 
 
 
155 aa  90.5  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.42 
 
 
168 aa  89.7  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.51 
 
 
157 aa  90.1  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  61.54 
 
 
79 aa  89.7  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  61.73 
 
 
136 aa  89.7  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.46 
 
 
163 aa  89.7  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.5 
 
 
169 aa  88.2  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.99 
 
 
154 aa  87.8  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.42 
 
 
172 aa  85.5  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  38.18 
 
 
155 aa  85.5  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.67 
 
 
163 aa  84.7  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.52 
 
 
167 aa  84.3  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  42.95 
 
 
152 aa  84.3  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  45.16 
 
 
172 aa  84  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.71 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.58 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  56.41 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  54.65 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  49.45 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.76 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.06 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.55 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.21 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  34.78 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  35.26 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  36.2 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  45.83 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  64.29 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  78.26 
 
 
48 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  33.96 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.73 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  57.38 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  48.81 
 
 
527 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  32.58 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  48.81 
 
 
634 aa  68.2  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  35.8 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.72 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  47.62 
 
 
567 aa  66.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  42.24 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  42.24 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64.41 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  44.44 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  46.34 
 
 
548 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  44.62 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  69.05 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.36 
 
 
165 aa  58.9  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  50.85 
 
 
167 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  44.62 
 
 
134 aa  58.9  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  38.53 
 
 
111 aa  58.5  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  46.03 
 
 
153 aa  58.2  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  42.5 
 
 
137 aa  58.2  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  45.45 
 
 
196 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  29.49 
 
 
162 aa  58.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  50.88 
 
 
132 aa  57.8  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  61.9 
 
 
166 aa  57.8  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1532  putative transformation system protein CtsG  41.27 
 
 
190 aa  57.4  0.00000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  31.9 
 
 
186 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  29.61 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  30 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  40.85 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  31.9 
 
 
186 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  61.9 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  44.07 
 
 
178 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  52.94 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  52.83 
 
 
141 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  35.48 
 
 
131 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1532  transformation system protein  38.46 
 
 
171 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  49.12 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.38 
 
 
121 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  61.22 
 
 
138 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  47.62 
 
 
133 aa  55.1  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  41.24 
 
 
168 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  43.75 
 
 
167 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  42.31 
 
 
178 aa  54.7  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  29.29 
 
 
136 aa  54.7  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  39.47 
 
 
185 aa  54.7  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>