More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1529 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  100 
 
 		 141 aa  275  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  53.9 
 
 		 140 aa  148  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2511  UspA domain-containing protein  59.57 
 
 		 143 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.947152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  40.85 
 
 		 148 aa  100  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  40.43 
 
 		 140 aa  100  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  41.84 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  37.59 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  38.69 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  37.96 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  36.43 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  30.28 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  30.28 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.87 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  29.58 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  32.17 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  29.58 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  34.03 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  34.48 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  32.14 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  35.51 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  34.25 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.17 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  29.86 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  28.87 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  28.87 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.47 
 
 		 150 aa  72  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  28.87 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  32.39 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  28.87 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  35.46 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  28.87 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  30.77 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  31.47 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  29.86 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  33.8 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  34.27 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  25.9 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  30.07 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  33.33 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  36.62 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  31.47 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  30.99 
 
 		 286 aa  67.8  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0913  UspA domain-containing protein  36.69 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03760  universal stress protein UspA-like protein  32.69 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00361063  normal  0.318246 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  34.01 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  35.86 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.56 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  35.71 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  30.07 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1924  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164923 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2020  UspA domain protein  34.57 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000426305 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  33.33 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1531  UspA domain protein  29.71 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00154671  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0650  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 323 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  30.14 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1591  hypothetical protein  32.39 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  32.64 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  33.57 
 
 		 287 aa  64.7  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  34.64 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  34 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  31.51 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  30.71 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  35.86 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  30.56 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  32.87 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  32.88 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 449 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  29.86 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  30.14 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.46 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  31.88 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  31.08 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  27.97 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>