More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0293 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1703  extracellular solute-binding protein family 5  74.12 
 
 		 638 aa  974    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0293  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 640 aa  1316    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.835457  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1677  extracellular solute-binding protein  50.4 
 
 		 655 aa  643    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224475  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1687  extracellular solute-binding protein  48.49 
 
 		 664 aa  579  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.789812  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  47.76 
 
 		 655 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0622  extracellular solute-binding protein  42.63 
 
 		 658 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.16709  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0608  extracellular solute-binding protein  42.63 
 
 		 658 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0360846  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  43.78 
 
 		 657 aa  528  1e-148  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0500  extracellular solute-binding protein  45.26 
 
 		 643 aa  523  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.464453  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  43.94 
 
 		 657 aa  521  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5515  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  39.06 
 
 		 633 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2454  extracellular solute-binding protein  38.26 
 
 		 682 aa  391  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39331 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  36.83 
 
 		 645 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  36.55 
 
 		 645 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5255  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 		 651 aa  344  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4483  twin-arginine translocation pathway signal  33.6 
 
 		 686 aa  339  9e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5555  extracellular solute-binding protein  32.05 
 
 		 642 aa  320  6e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140103  normal  0.0740019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14300  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.7 
 
 		 671 aa  319  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.860083 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5700  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  32.18 
 
 		 638 aa  315  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0714934  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3373  extracellular solute-binding protein family 5  30.9 
 
 		 641 aa  306  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0279191  normal  0.223354 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7124  extracellular solute-binding protein family 5  32.75 
 
 		 635 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104115  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4593  extracellular solute-binding protein  33.61 
 
 		 633 aa  301  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.996188 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1927  extracellular solute-binding protein family 5  31.97 
 
 		 735 aa  300  7e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1530  extracellular solute-binding protein family 5  32.76 
 
 		 656 aa  297  3e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1805  extracellular solute-binding protein family 5  31.82 
 
 		 659 aa  297  5e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0309  extracellular solute-binding protein family 5  31.98 
 
 		 765 aa  295  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5971  extracellular solute-binding protein family 5  33.44 
 
 		 635 aa  291  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.989436  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2113  extracellular solute-binding protein family 5  31.45 
 
 		 729 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7228  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 		 664 aa  283  8.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0309461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2808  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 727 aa  282  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2424  extracellular solute-binding protein  31.41 
 
 		 728 aa  280  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.935396 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2110  extracellular solute-binding protein  31.68 
 
 		 735 aa  278  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3050  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 757 aa  278  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0190244  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3931  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  32.4 
 
 		 626 aa  275  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0595  extracellular solute-binding protein family 5  31.05 
 
 		 645 aa  273  6e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6476  extracellular solute-binding protein  33.66 
 
 		 643 aa  270  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.864629 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3683  extracellular solute-binding protein  31.21 
 
 		 639 aa  266  7e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.378617  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3160  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  29.61 
 
 		 679 aa  252  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2830  extracellular solute-binding protein  33.53 
 
 		 655 aa  239  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108136  normal  0.289716 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  26.84 
 
 		 573 aa  172  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  27.07 
 
 		 589 aa  171  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  25.09 
 
 		 578 aa  169  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  28.65 
 
 		 580 aa  164  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 584 aa  164  6e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4140  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 		 693 aa  161  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0860796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5120  ABC transporter substrate binding protein (alpha-galactoside)  26.32 
 
 		 695 aa  160  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0244807  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  26.14 
 
 		 589 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6877  extracellular solute-binding protein family 5  26.86 
 
 		 695 aa  157  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0668794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5907  extracellular solute-binding protein family 5  26.42 
 
 		 696 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  29.47 
 
 		 578 aa  135  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  27.09 
 
 		 584 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 578 aa  127  8.000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 587 aa  126  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  26.46 
 
 		 587 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  25.36 
 
 		 607 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 577 aa  120  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 591 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  27.18 
 
 		 533 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  26.56 
 
 		 577 aa  117  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 595 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  28.36 
 
 		 538 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 607 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  26.68 
 
 		 534 aa  115  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  25.11 
 
 		 544 aa  115  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 579 aa  115  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 579 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  24.94 
 
 		 544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 594 aa  111  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  24.22 
 
 		 627 aa  111  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  24.89 
 
 		 587 aa  110  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 		 638 aa  110  8.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.61 
 
 		 538 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 536 aa  108  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 565 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.78 
 
 		 546 aa  101  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 539 aa  101  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 544 aa  99.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 544 aa  99  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 588 aa  97.4  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  27.18 
 
 		 581 aa  96.7  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  23.85 
 
 		 545 aa  96.3  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  24.73 
 
 		 581 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 510 aa  95.9  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 540 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  24.25 
 
 		 526 aa  95.1  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  24.04 
 
 		 540 aa  95.5  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 551 aa  95.1  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 		 597 aa  95.5  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  22.97 
 
 		 554 aa  94  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0332  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 523 aa  93.2  1e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  24.24 
 
 		 557 aa  93.6  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  25.12 
 
 		 537 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0885  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.99 
 
 		 541 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.575043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.95 
 
 		 539 aa  91.3  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2258  extracellular solute-binding protein family 5  26.67 
 
 		 591 aa  91.7  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000752385  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 541 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 530 aa  90.5  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 532 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 		 535 aa  90.1  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 541 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>