194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2434 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  100 
 
 
914 aa  1891    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1514  phospholipase D/transphosphatidylase  46.51 
 
 
1190 aa  340  9.999999999999999e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884215  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1238  phospholipase D/transphosphatidylase  43.87 
 
 
1178 aa  336  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.927717  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  47.2 
 
 
1171 aa  331  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1979  phospholipase D/transphosphatidylase  45.16 
 
 
1178 aa  327  5e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  34.33 
 
 
1062 aa  311  5e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  42.23 
 
 
975 aa  308  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3025  hypothetical protein  40.38 
 
 
1176 aa  277  5e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0376122  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  38.16 
 
 
1185 aa  234  8.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5347  DNA topoisomerase  32.22 
 
 
1335 aa  174  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  25.67 
 
 
1132 aa  90.9  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1760  hypothetical protein  24.56 
 
 
1220 aa  88.2  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.5 
 
 
1203 aa  87  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3984  DNA helicase related protein  23.67 
 
 
1087 aa  85.1  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  27.71 
 
 
1523 aa  84.7  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  22.28 
 
 
928 aa  83.6  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  28.87 
 
 
925 aa  84  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  24.4 
 
 
1056 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  23.21 
 
 
916 aa  84  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  25.65 
 
 
1126 aa  81.6  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  23.45 
 
 
629 aa  80.9  0.00000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1989  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.19 
 
 
605 aa  79.7  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0620689  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1254  DNA helicase related protein  24.48 
 
 
1094 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  24.57 
 
 
946 aa  79.3  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6959  DNA helicase related protein  23.47 
 
 
1157 aa  78.2  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181684  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1899  hypothetical protein  25.07 
 
 
549 aa  77.4  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.571929  hitchhiker  0.00194399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.91 
 
 
1196 aa  77  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  25.22 
 
 
958 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  25.48 
 
 
1490 aa  75.5  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  26.17 
 
 
1474 aa  75.5  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4016  hypothetical protein  25.34 
 
 
1100 aa  73.9  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00472  hypothetical protein  25.07 
 
 
1049 aa  73.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0358017  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  23.08 
 
 
1002 aa  70.5  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  25.32 
 
 
1557 aa  70.1  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  27.93 
 
 
1143 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  28.17 
 
 
1143 aa  68.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  28.17 
 
 
1143 aa  68.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3443  superfamily I DNA/RNA helicase  23.75 
 
 
1061 aa  68.2  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  24.6 
 
 
905 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  24.6 
 
 
905 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  25.08 
 
 
1151 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  24.84 
 
 
900 aa  67.4  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  25.31 
 
 
1270 aa  66.2  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3992  hypothetical protein  23.3 
 
 
1126 aa  66.6  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  23.67 
 
 
905 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  25.95 
 
 
1163 aa  67  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  24.67 
 
 
905 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  28.1 
 
 
1489 aa  66.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  23.45 
 
 
1116 aa  65.9  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  20.88 
 
 
903 aa  65.5  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  28.85 
 
 
1139 aa  65.5  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  26.15 
 
 
754 aa  65.1  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  24.43 
 
 
908 aa  65.1  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  25.14 
 
 
1189 aa  64.7  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  27.16 
 
 
1790 aa  64.7  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  23.68 
 
 
907 aa  64.3  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  27.24 
 
 
1099 aa  64.3  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  24.76 
 
 
1082 aa  63.9  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  24.83 
 
 
636 aa  64.3  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  25.34 
 
 
636 aa  64.3  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  22.46 
 
 
1724 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4321  hypothetical protein  22.99 
 
 
1126 aa  63.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  24.03 
 
 
905 aa  63.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  24.6 
 
 
941 aa  62.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  22.01 
 
 
1980 aa  62.4  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  25.15 
 
 
932 aa  62.4  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.08 
 
 
752 aa  62.4  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  28.74 
 
 
914 aa  62.4  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  23.79 
 
 
635 aa  62  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  21.9 
 
 
1296 aa  61.2  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  25.5 
 
 
1575 aa  60.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  23.37 
 
 
906 aa  60.8  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  25.63 
 
 
1121 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  24.58 
 
 
902 aa  60.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1889  hypothetical protein  23.1 
 
 
1092 aa  60.1  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  23.79 
 
 
585 aa  59.7  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  24.01 
 
 
1801 aa  59.7  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  25.96 
 
 
922 aa  59.3  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  35.29 
 
 
748 aa  59.3  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  23.4 
 
 
2125 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  23.4 
 
 
2125 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  22.84 
 
 
1403 aa  58.5  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  25.59 
 
 
1215 aa  58.5  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1784  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.99 
 
 
1164 aa  58.5  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0724834  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  24.42 
 
 
633 aa  58.5  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  21.91 
 
 
2759 aa  58.2  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  24.08 
 
 
1038 aa  58.2  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  21.13 
 
 
2045 aa  58.2  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  23.42 
 
 
758 aa  58.2  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  21.7 
 
 
1973 aa  57.8  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  25.84 
 
 
553 aa  57.4  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  25.84 
 
 
553 aa  57.4  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  28.15 
 
 
1121 aa  57  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  24.77 
 
 
2005 aa  57  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  23.81 
 
 
632 aa  57  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  24.83 
 
 
1620 aa  56.2  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  37.21 
 
 
655 aa  56.6  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2785  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  22.42 
 
 
1477 aa  56.2  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.464639 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  36.78 
 
 
759 aa  56.2  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  36.78 
 
 
759 aa  56.2  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>