More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2187 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  100 
 
 
173 aa  359  1e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  60.36 
 
 
172 aa  215  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0787  nitroreductase family protein  62.28 
 
 
177 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0290068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  58.54 
 
 
167 aa  192  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2852  nitroreductase  62.05 
 
 
178 aa  191  5e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  58.08 
 
 
167 aa  185  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  49.11 
 
 
170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  47.95 
 
 
180 aa  163  9e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  48.78 
 
 
177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  49.12 
 
 
174 aa  146  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  33.99 
 
 
166 aa  94  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  35.88 
 
 
176 aa  91.7  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  36.88 
 
 
174 aa  89.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  32.52 
 
 
169 aa  89.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  29.67 
 
 
187 aa  87.8  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  36.25 
 
 
169 aa  87  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  35.09 
 
 
174 aa  85.5  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  30.67 
 
 
165 aa  85.5  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  28.99 
 
 
171 aa  85.1  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  30.59 
 
 
176 aa  84.3  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  34.16 
 
 
163 aa  84  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  31.87 
 
 
169 aa  84  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  33.12 
 
 
171 aa  84  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  30.92 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  32.73 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  30.49 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  25.64 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  32.24 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  30.59 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  32.16 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  30.77 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  31.58 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  31.58 
 
 
173 aa  79  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  29.53 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  30.3 
 
 
190 aa  77.4  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  31.55 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  26.64 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  28.5 
 
 
245 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  26.92 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  31.65 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  26.38 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  28.74 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  33.33 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  35.26 
 
 
174 aa  73.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  32.67 
 
 
169 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  34.01 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  31.11 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  32.73 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  34.38 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  35.33 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  28.18 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  31.55 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  26.2 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  30.61 
 
 
201 aa  72  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  28.18 
 
 
191 aa  72  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  30.29 
 
 
191 aa  72  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  30.65 
 
 
334 aa  72  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  32.85 
 
 
180 aa  72  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  34.23 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  34.23 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  31.55 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.89 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  25 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  40.43 
 
 
169 aa  71.2  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  31.74 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  30.46 
 
 
166 aa  70.9  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  35.09 
 
 
348 aa  70.9  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  28.83 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  34.81 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  29.85 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  30.87 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  29.44 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  30.46 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  26.11 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  32.58 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  30.07 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  31.52 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  26.11 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  26.92 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  28.21 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  29.34 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  28.33 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  28.3 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  25 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  26.87 
 
 
212 aa  67.8  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  29.17 
 
 
199 aa  67.4  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  30.61 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1628  nitroreductase  31.55 
 
 
207 aa  67.8  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  31.22 
 
 
199 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  28.36 
 
 
226 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  28.36 
 
 
226 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  34.55 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  28.36 
 
 
226 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.03 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.86 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  33.93 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  28.48 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  26.47 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  29.81 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  31.87 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>