More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1549 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
710 aa  1453    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.67 
 
 
913 aa  552  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.87 
 
 
287 aa  306  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.48 
 
 
287 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.553198 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.74 
 
 
301 aa  296  7e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.35 
 
 
288 aa  296  7e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.73 
 
 
287 aa  293  8e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.73 
 
 
287 aa  293  8e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0938298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3672  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.15 
 
 
299 aa  290  4e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382013  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10149  short-chain type dehydrogenase/reductase  56 
 
 
286 aa  291  4e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.65 
 
 
298 aa  290  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0473963 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.06 
 
 
306 aa  278  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19730  oxidoreductase  53.41 
 
 
303 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1699  short-chain dehydrogenase  53.01 
 
 
303 aa  271  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.650982  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.44 
 
 
300 aa  271  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.42 
 
 
303 aa  269  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362955  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.71 
 
 
326 aa  269  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130256  normal  0.744191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.34 
 
 
302 aa  269  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662956  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  49.69 
 
 
901 aa  267  5.999999999999999e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1025  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.41 
 
 
303 aa  266  8e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.81 
 
 
304 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707593  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.63 
 
 
306 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.4 
 
 
303 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.67 
 
 
303 aa  263  6e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170855 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.05 
 
 
303 aa  263  8e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.935758  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1187  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  50.81 
 
 
306 aa  263  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.02 
 
 
300 aa  262  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.490724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.72 
 
 
305 aa  260  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.98 
 
 
307 aa  260  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.36 
 
 
305 aa  257  6e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.53 
 
 
302 aa  255  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.928177  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.36 
 
 
305 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7556  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
310 aa  255  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206699  normal  0.239691 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.79 
 
 
302 aa  254  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  53.69 
 
 
903 aa  249  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  45.22 
 
 
893 aa  248  3e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3584  putative 3-oxo-(acyl) acyl carrier protein reductase  46.38 
 
 
305 aa  248  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.185975 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
305 aa  244  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.21 
 
 
300 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277304  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.36 
 
 
304 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.119324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.66 
 
 
313 aa  230  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.65 
 
 
306 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0264564  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.65 
 
 
306 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.583445  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.65 
 
 
306 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227424  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.1 
 
 
292 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.943405  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.05 
 
 
315 aa  224  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.46 
 
 
313 aa  220  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3224  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  41.84 
 
 
283 aa  219  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4033  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  42.2 
 
 
283 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0577  dehydratase  39.72 
 
 
283 aa  213  9e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5003  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR)  48.02 
 
 
292 aa  208  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.874894  normal  0.0924335 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2572  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.32 
 
 
324 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.710215  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.32 
 
 
324 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.32 
 
 
324 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.88 
 
 
296 aa  207  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.89 
 
 
330 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872032  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.84 
 
 
298 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0205558  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.26 
 
 
304 aa  201  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0490  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  41.28 
 
 
283 aa  200  9e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
324 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149796  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
309 aa  196  1e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2739  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.42 
 
 
311 aa  194  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2930  putative short-chain dehydrogenase  43.37 
 
 
304 aa  193  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
301 aa  193  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072083  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
304 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0386113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
303 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.707326  normal  0.647553 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51090  putative short-chain dehydrogenase  41.98 
 
 
305 aa  188  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  decreased coverage  0.0000000605367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
304 aa  188  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0854681  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.52 
 
 
294 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089985 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
304 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336775  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4681  short chain dehydrogenase  42.57 
 
 
301 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351016  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5066  short chain dehydrogenase  42.57 
 
 
301 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.567593 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4767  short chain dehydrogenase  42.57 
 
 
301 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1492  short chain dehydrogenase  43.78 
 
 
301 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3834  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
303 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.31 
 
 
301 aa  186  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4360  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.39 
 
 
305 aa  185  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5264  short chain dehydrogenase  42.57 
 
 
301 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.22 
 
 
301 aa  183  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 
301 aa  181  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.83 
 
 
306 aa  179  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.77 
 
 
301 aa  180  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.07 
 
 
310 aa  179  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13581  short chain dehydrogenase  40.61 
 
 
304 aa  177  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0990591 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6296  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
305 aa  176  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953973  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.23 
 
 
334 aa  176  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5238  dehydratase  39.35 
 
 
286 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.263636 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
300 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3605  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  38.26 
 
 
286 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.253459  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2352  MaoC-like dehydratase  38.61 
 
 
286 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
316 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0535694  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4199  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  38.89 
 
 
288 aa  174  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
301 aa  174  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.63 
 
 
301 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2341  short chain dehydrogenase  41.5 
 
 
291 aa  173  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199722  decreased coverage  0.00200779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3386  MaoC-like dehydratase  36.84 
 
 
286 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263784  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3113  MaoC-like dehydratase  37.5 
 
 
286 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107347  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.94 
 
 
320 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
305 aa  171  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1518  dehydratase  39.61 
 
 
286 aa  171  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>