92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5238 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5238  dehydratase  100 
 
 
286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.263636 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1518  dehydratase  93.01 
 
 
286 aa  522  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4663  MaoC-like dehydratase  83.16 
 
 
286 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4751  dehydratase  83.16 
 
 
286 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5046  dehydratase  83.16 
 
 
286 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13571  dehydrogenase  74.13 
 
 
286 aa  422  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000153727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0894  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  56.74 
 
 
287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854145  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3852  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  57.35 
 
 
285 aa  297  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2781  dehydratase  54.17 
 
 
282 aa  285  4e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5896  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  51.41 
 
 
285 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2677  dehydratase  51.41 
 
 
276 aa  256  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211797  normal  0.0433405 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2885  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  51.06 
 
 
278 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409095  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0490  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  40.28 
 
 
283 aa  209  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3386  MaoC-like dehydratase  40.45 
 
 
286 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263784  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2352  MaoC-like dehydratase  38.14 
 
 
286 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3605  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  37.46 
 
 
286 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.253459  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3113  MaoC-like dehydratase  37.8 
 
 
286 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107347  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.35 
 
 
710 aa  190  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5004  putative dehydratase  40.69 
 
 
286 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.133052 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5282  MaoC-like dehydratase  37.86 
 
 
285 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1135  MaoC-like dehydratase  41.34 
 
 
290 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1528  dehydratase  42.65 
 
 
288 aa  169  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3404  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  33.57 
 
 
286 aa  168  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4895  dehydratase  40 
 
 
291 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0215667 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7330  MaoC-like dehydratase  38.33 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881634  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5520  acyl dehydratase (MaoC-like domain)  38.19 
 
 
291 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1800  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  38.66 
 
 
282 aa  162  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51160  hypothetical protein  39.03 
 
 
288 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000524092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1597  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  37.84 
 
 
286 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5305  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  38.21 
 
 
283 aa  159  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0297084  normal  0.691461 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4366  hypothetical protein  39.03 
 
 
288 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1197  dehydratase  40.45 
 
 
289 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.72908  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1180  MaoC-like dehydratase  40.45 
 
 
289 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.637996  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1207  dehydratase  40.45 
 
 
289 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273063  normal  0.0226898 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  37.41 
 
 
893 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6855  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  38.52 
 
 
289 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13423  dehydrogenase  40.91 
 
 
290 aa  149  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.012910000000001e-28  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3807  putative dehydratase  35.03 
 
 
297 aa  149  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0121  dehydratase  36.36 
 
 
297 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0195  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  34.64 
 
 
315 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0139  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  35.27 
 
 
297 aa  143  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4199  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  40.87 
 
 
288 aa  142  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  34.02 
 
 
903 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3478  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  37.77 
 
 
265 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  32.95 
 
 
901 aa  121  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2346  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  35.94 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00138691  normal  0.0743617 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2580  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  37.55 
 
 
289 aa  118  9e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3224  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  28.02 
 
 
283 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4033  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  27.63 
 
 
283 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0577  dehydratase  27.17 
 
 
283 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09041  conserved hypothetical protein  29.25 
 
 
295 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.238331  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1830  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  27.03 
 
 
290 aa  93.2  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.288038 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02577  peroxisomal dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00640)  28.46 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.560987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  28.29 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  30.68 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03381  conserved hypothetical protein  32.18 
 
 
1872 aa  52.8  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.888019  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0161  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
140 aa  50.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.49242  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3812  MaoC-like dehydratase  29.37 
 
 
140 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0106778  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  32.95 
 
 
141 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3533  MaoC domain protein dehydratase  34.69 
 
 
138 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0994  dehydrogenase  35.85 
 
 
134 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0580228  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2849  dehydratase  23.79 
 
 
288 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0197  MaoC domain protein dehydratase  30.32 
 
 
297 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1315  MaoC domain protein dehydratase  27.14 
 
 
3102 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07873  fatty acid synthase beta subunit, putative (JCVI)  33.33 
 
 
2111 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.826849  normal  0.601951 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38940  acyl dehydratase  25.79 
 
 
286 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04370  fatty-acid synthase complex protein, putative  31.94 
 
 
2513 aa  47  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0195236  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3661  fatty acid synthase  30 
 
 
3075 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.23097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3648  fatty acid synthase  30 
 
 
3077 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3724  MaoC domain protein dehydratase  33.72 
 
 
141 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3721  fatty acid synthase  30 
 
 
3077 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.875058 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2532  dehydratase  27.4 
 
 
3087 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0140  dehydratase  29.3 
 
 
297 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4076  MaoC-like dehydratase  27.34 
 
 
137 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2779  MaoC domain protein dehydratase  38.24 
 
 
135 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  26.96 
 
 
337 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  38.24 
 
 
146 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4125  dehydratase  26.71 
 
 
3097 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  28.57 
 
 
138 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  35 
 
 
138 aa  43.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1258  dehydratase  31.36 
 
 
280 aa  43.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196595  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2748  MaoC domain protein dehydratase  44.74 
 
 
140 aa  43.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.149372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2872  MaoC domain protein dehydratase  38.24 
 
 
135 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1994  MaoC domain protein dehydratase  26.18 
 
 
3083 aa  43.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0370  MaoC domain protein dehydratase  55.56 
 
 
130 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.758804 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0619  dehydratase  32.26 
 
 
283 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965685  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  35.44 
 
 
141 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  35.44 
 
 
141 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  35.44 
 
 
141 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0239  MaoC-like dehydratase  24.17 
 
 
281 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  37.31 
 
 
137 aa  42.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0249  dehydratase  24.17 
 
 
281 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.315586 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>