55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3224 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3224  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  100 
 
 		 283 aa  593  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4033  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  90.11 
 
 		 283 aa  548  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0577  dehydratase  68.9 
 
 		 283 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1830  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  49.66 
 
 		 290 aa  300  2e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.288038 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.84 
 
 		 710 aa  219  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0490  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  36.97 
 
 		 283 aa  167  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5282  MaoC-like dehydratase  34.94 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2352  MaoC-like dehydratase  32.3 
 
 		 286 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1597  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  34.7 
 
 		 286 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5520  acyl dehydratase (MaoC-like domain)  35 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6855  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  35.66 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1135  MaoC-like dehydratase  34.81 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3113  MaoC-like dehydratase  31.96 
 
 		 286 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107347  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3605  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  32.26 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.253459  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3386  MaoC-like dehydratase  33.7 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3404  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  31.84 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1528  dehydratase  32.44 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13423  dehydrogenase  33.45 
 
 		 290 aa  126  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.012910000000001e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7330  MaoC-like dehydratase  30.36 
 
 		 291 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1207  dehydratase  33.09 
 
 		 289 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273063  normal  0.0226898 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1197  dehydratase  33.09 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.72908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1180  MaoC-like dehydratase  33.09 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.637996  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2885  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  33.33 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409095  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0195  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  31.5 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2677  dehydratase  33.33 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211797  normal  0.0433405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5896  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  31.8 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4895  dehydratase  32.1 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0215667 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4751  dehydratase  31.8 
 
 		 286 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4663  MaoC-like dehydratase  31.8 
 
 		 286 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5046  dehydratase  31.8 
 
 		 286 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5004  putative dehydratase  32.73 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.133052 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3852  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  31.98 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0139  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  30.92 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0121  dehydratase  30.92 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.254652 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  32.38 
 
 		 903 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4199  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  30.86 
 
 		 288 aa  109  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13571  dehydrogenase  30.27 
 
 		 286 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000153727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0894  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  30.6 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854145  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3807  putative dehydratase  30.65 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1518  dehydratase  28.63 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4366  hypothetical protein  29.41 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51160  hypothetical protein  29 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000524092 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  32.12 
 
 		 893 aa  104  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5238  dehydratase  28.02 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263636 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2781  dehydratase  27.37 
 
 		 282 aa  99.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1800  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  30.42 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3478  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  28.57 
 
 		 265 aa  96.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09041  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 		 295 aa  95.5  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.238331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5305  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  30.4 
 
 		 283 aa  93.2  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0297084  normal  0.691461 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2580  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  30.51 
 
 		 289 aa  88.6  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  25.49 
 
 		 901 aa  81.3  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2346  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  27.34 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00138691  normal  0.0743617 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02577  peroxisomal dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00640)  23.75 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.560987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  28.04 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  28.18 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>