104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13571 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13571  dehydrogenase  100 
 
 
286 aa  578  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000153727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4663  MaoC-like dehydratase  77.54 
 
 
286 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4751  dehydratase  77.54 
 
 
286 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5046  dehydratase  77.54 
 
 
286 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1518  dehydratase  75.52 
 
 
286 aa  427  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5238  dehydratase  74.13 
 
 
286 aa  421  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.263636 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0894  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  56.69 
 
 
287 aa  309  4e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854145  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3852  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  58.05 
 
 
285 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2781  dehydratase  53.82 
 
 
282 aa  276  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2677  dehydratase  52.11 
 
 
276 aa  255  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211797  normal  0.0433405 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2885  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  52.48 
 
 
278 aa  255  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409095  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5896  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  50.87 
 
 
285 aa  249  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0490  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  40.64 
 
 
283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3386  MaoC-like dehydratase  40.62 
 
 
286 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263784  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2352  MaoC-like dehydratase  41.09 
 
 
286 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3113  MaoC-like dehydratase  40.88 
 
 
286 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107347  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3605  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  40.36 
 
 
286 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.253459  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5004  putative dehydratase  41.92 
 
 
286 aa  185  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.133052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1528  dehydratase  42.42 
 
 
288 aa  178  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1180  MaoC-like dehydratase  44.15 
 
 
289 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.637996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1197  dehydratase  44.15 
 
 
289 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.72908  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1207  dehydratase  44.15 
 
 
289 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273063  normal  0.0226898 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4895  dehydratase  45.45 
 
 
291 aa  175  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0215667 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.32 
 
 
710 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51160  hypothetical protein  39.55 
 
 
288 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000524092 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3404  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  34.27 
 
 
286 aa  169  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1800  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  39.71 
 
 
282 aa  169  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5305  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  40 
 
 
283 aa  168  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0297084  normal  0.691461 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1135  MaoC-like dehydratase  41.16 
 
 
290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4366  hypothetical protein  38.95 
 
 
288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1597  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  39.86 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7330  MaoC-like dehydratase  38.31 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881634  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5282  MaoC-like dehydratase  35.05 
 
 
285 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5520  acyl dehydratase (MaoC-like domain)  36.79 
 
 
291 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0195  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  35.02 
 
 
315 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3807  putative dehydratase  36.3 
 
 
297 aa  145  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  34.36 
 
 
903 aa  143  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13423  dehydrogenase  39.21 
 
 
290 aa  143  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.012910000000001e-28  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  34.45 
 
 
893 aa  142  6e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0121  dehydratase  37.04 
 
 
297 aa  142  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0139  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  36.3 
 
 
297 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6855  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  35.17 
 
 
289 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4199  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  39.29 
 
 
288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3478  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  37.02 
 
 
265 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3224  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  28.57 
 
 
283 aa  122  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2580  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  37.69 
 
 
289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4033  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  29.71 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  33.59 
 
 
901 aa  117  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2346  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00138691  normal  0.0743617 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0577  dehydratase  27.08 
 
 
283 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09041  conserved hypothetical protein  27.7 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.238331  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02577  peroxisomal dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00640)  30 
 
 
316 aa  94.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.560987 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1830  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  27.41 
 
 
290 aa  88.6  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.288038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  28.35 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  29.72 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04370  fatty-acid synthase complex protein, putative  26.92 
 
 
2513 aa  53.1  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0195236  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03381  conserved hypothetical protein  28.7 
 
 
1872 aa  52.8  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.888019  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1315  MaoC domain protein dehydratase  26.18 
 
 
3102 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3812  MaoC-like dehydratase  32.67 
 
 
140 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0106778  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0619  dehydratase  27.57 
 
 
283 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965685  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3661  fatty acid synthase  29.09 
 
 
3075 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.23097 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0206  dehydratase  29.63 
 
 
133 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  28.8 
 
 
141 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38940  acyl dehydratase  28.5 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4316  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  34.62 
 
 
481 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4426  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  34.62 
 
 
481 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0161  MaoC domain protein dehydratase  29.13 
 
 
140 aa  47.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.49242  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3648  fatty acid synthase  28.48 
 
 
3077 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3721  fatty acid synthase  28.48 
 
 
3077 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.875058 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3533  MaoC domain protein dehydratase  38.24 
 
 
138 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0994  dehydrogenase  45.95 
 
 
134 aa  46.6  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0580228  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  40.74 
 
 
139 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30160  3-Re enoyl-CoA hydratase PhaJ  32.41 
 
 
156 aa  46.2  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1994  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
3083 aa  46.2  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  27.59 
 
 
156 aa  45.8  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07873  fatty acid synthase beta subunit, putative (JCVI)  28.95 
 
 
2111 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.826849  normal  0.601951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0580  MaoC domain-containing protein  26.49 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4356  MaoC-like dehydratase  33.33 
 
 
156 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  28.95 
 
 
151 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2532  dehydratase  26.88 
 
 
3087 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21390  acyl dehydratase  42.86 
 
 
157 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000515647  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  28.43 
 
 
138 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3182  MaoC domain protein dehydratase  44.07 
 
 
143 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0456076 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17510  acyl dehydratase  40.68 
 
 
163 aa  44.3  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.736026  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2748  MaoC domain protein dehydratase  47.37 
 
 
140 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.149372  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4076  MaoC-like dehydratase  29.35 
 
 
137 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  39.29 
 
 
138 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3724  MaoC domain protein dehydratase  34.85 
 
 
141 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4125  dehydratase  26.35 
 
 
3097 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2926  putative MaoC-like dehydratase  32.35 
 
 
147 aa  43.5  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.997708  normal  0.0377556 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3847  dehydratase  30.51 
 
 
156 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4552  MaoC domain protein dehydratase  30.51 
 
 
156 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228955  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2195  dehydratase  31.19 
 
 
147 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1337  dehydratase  30.51 
 
 
156 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1081  dehydratase  25.69 
 
 
135 aa  43.5  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4059  dehydratase  30.51 
 
 
156 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  31.82 
 
 
337 aa  42.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  32.29 
 
 
146 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0140  dehydratase  25.91 
 
 
297 aa  42.7  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3256  MaoC domain protein dehydratase  51.72 
 
 
137 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.157915 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>