84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3404 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3404  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  100 
 
 		 286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5282  MaoC-like dehydratase  44.52 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5520  acyl dehydratase (MaoC-like domain)  42.46 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51160  hypothetical protein  44.33 
 
 		 288 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000524092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4366  hypothetical protein  44.68 
 
 		 288 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253028  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6855  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  42.96 
 
 		 289 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0490  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  41.2 
 
 		 283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1135  MaoC-like dehydratase  40.99 
 
 		 290 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1597  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  39.79 
 
 		 286 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7330  MaoC-like dehydratase  41.26 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0121  dehydratase  41.69 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0139  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  41.36 
 
 		 297 aa  211  7e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3807  putative dehydratase  42.37 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0195  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  40.4 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2580  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  44.37 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3605  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  36.46 
 
 		 286 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.253459  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3113  MaoC-like dehydratase  37.15 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107347  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2352  MaoC-like dehydratase  36.46 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3386  MaoC-like dehydratase  36.81 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5004  putative dehydratase  37.15 
 
 		 286 aa  179  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.133052 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4751  dehydratase  36.01 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5046  dehydratase  36.01 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4663  MaoC-like dehydratase  36.01 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4895  dehydratase  39.77 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0215667 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1518  dehydratase  33.57 
 
 		 286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3852  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  34.83 
 
 		 285 aa  159  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1528  dehydratase  37.45 
 
 		 288 aa  158  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 		 710 aa  156  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2677  dehydratase  37.28 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211797  normal  0.0433405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5238  dehydratase  32.52 
 
 		 286 aa  153  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263636 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1197  dehydratase  36.59 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.72908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1180  MaoC-like dehydratase  36.59 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.637996  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1207  dehydratase  36.59 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273063  normal  0.0226898 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13571  dehydrogenase  34.27 
 
 		 286 aa  152  8e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000153727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2885  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  38.43 
 
 		 278 aa  152  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409095  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0894  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  34.17 
 
 		 287 aa  152  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5896  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  32.61 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13423  dehydrogenase  38.27 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.012910000000001e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5305  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  36.58 
 
 		 283 aa  142  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0297084  normal  0.691461 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1800  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  34.53 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3224  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  31.84 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4199  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  34.24 
 
 		 288 aa  132  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0577  dehydratase  29.21 
 
 		 283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4033  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  30.6 
 
 		 283 aa  125  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3478  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  33.82 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2346  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  35.45 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00138691  normal  0.0743617 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09041  conserved hypothetical protein  29.14 
 
 		 295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.238331  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  32.86 
 
 		 893 aa  115  6e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2781  dehydratase  31.18 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1830  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  29.13 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.288038 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  29.74 
 
 		 903 aa  107  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.928702 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02577  peroxisomal dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00640)  28.62 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.560987 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  25.9 
 
 		 901 aa  98.6  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  46.38 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03381  conserved hypothetical protein  27.19 
 
 		 1872 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.888019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2779  MaoC domain protein dehydratase  40.86 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  47.76 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2872  MaoC domain protein dehydratase  47.76 
 
 		 135 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2677  dehydratase  44.93 
 
 		 135 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0345161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  28.23 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0580  MaoC-like dehydratase  35.79 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3661  fatty acid synthase  30.81 
 
 		 3075 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.23097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3648  fatty acid synthase  30.81 
 
 		 3077 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3721  fatty acid synthase  30.81 
 
 		 3077 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.875058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4125  dehydratase  27.18 
 
 		 3097 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2532  dehydratase  28.57 
 
 		 3087 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0858  putative dehydratase  31.11 
 
 		 127 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586377  normal  0.419357 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03008  MaoC domain protein dehydratase  25.22 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104203  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  27.83 
 
 		 153 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0742  dehydratase  26.37 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.780848  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07873  fatty acid synthase beta subunit, putative (JCVI)  30.28 
 
 		 2111 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.826849  normal  0.601951 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3182  MaoC domain protein dehydratase  37.5 
 
 		 143 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0456076 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12545  fatty acid synthase fas  41.18 
 
 		 3069 aa  44.3  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.696473  decreased coverage  0.00343939 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0391  dehydratase  37.66 
 
 		 322 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128192 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  29.29 
 
 		 147 aa  43.5  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2849  dehydratase  26.25 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3661  dehydratase  27.78 
 
 		 148 aa  43.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.831738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2077  dehydratase  23.64 
 
 		 291 aa  42.7  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  37.78 
 
 		 141 aa  42.7  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1994  MaoC domain protein dehydratase  27.23 
 
 		 3083 aa  42.7  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3537  MaoC domain-containing protein  28.16 
 
 		 139 aa  42.7  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  36.92 
 
 		 335 aa  42.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4238  dehydratase  38.81 
 
 		 143 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3435  MaoC domain protein dehydratase  29.17 
 
 		 149 aa  42  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>