67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3478 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3478  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  100 
 
 
265 aa  531  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2346  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  58.49 
 
 
283 aa  267  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00138691  normal  0.0743617 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0490  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  41.06 
 
 
283 aa  189  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1800  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  40.38 
 
 
282 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5305  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  39.78 
 
 
283 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0297084  normal  0.691461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2885  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  41.27 
 
 
278 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409095  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2677  dehydratase  39.7 
 
 
276 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211797  normal  0.0433405 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  36.54 
 
 
903 aa  149  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3605  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  36.4 
 
 
286 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.253459  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2352  MaoC-like dehydratase  35.27 
 
 
286 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3113  MaoC-like dehydratase  35.27 
 
 
286 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107347  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0894  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  40.3 
 
 
287 aa  143  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854145  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
710 aa  139  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3386  MaoC-like dehydratase  35.36 
 
 
286 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263784  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4895  dehydratase  39.33 
 
 
291 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0215667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1528  dehydratase  36.67 
 
 
288 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13423  dehydrogenase  37.66 
 
 
290 aa  136  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.012910000000001e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3404  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  34.16 
 
 
286 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5282  MaoC-like dehydratase  34.98 
 
 
285 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1180  MaoC-like dehydratase  37.91 
 
 
289 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.637996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1197  dehydratase  37.91 
 
 
289 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.72908  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  31.89 
 
 
893 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1207  dehydratase  37.91 
 
 
289 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273063  normal  0.0226898 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4366  hypothetical protein  38.35 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253028  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1518  dehydratase  39.21 
 
 
286 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51160  hypothetical protein  37.88 
 
 
288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000524092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5520  acyl dehydratase (MaoC-like domain)  34.06 
 
 
291 aa  128  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2781  dehydratase  38.76 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5238  dehydratase  38.13 
 
 
286 aa  126  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.263636 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4199  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  39.26 
 
 
288 aa  125  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3852  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  39.76 
 
 
285 aa  125  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13571  dehydrogenase  36.63 
 
 
286 aa  122  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000153727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5896  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  37.83 
 
 
285 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  33.08 
 
 
901 aa  120  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5004  putative dehydratase  34.07 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.133052 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4751  dehydratase  34.89 
 
 
286 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5046  dehydratase  34.89 
 
 
286 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4663  MaoC-like dehydratase  34.89 
 
 
286 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0139  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  34.33 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1597  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  32.71 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1135  MaoC-like dehydratase  32.97 
 
 
290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0121  dehydratase  35.69 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.254652 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09041  conserved hypothetical protein  32.12 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.238331  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3807  putative dehydratase  36.4 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0195  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  34.52 
 
 
315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3224  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  30.12 
 
 
283 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6855  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  32.35 
 
 
289 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4033  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  31 
 
 
283 aa  105  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02577  peroxisomal dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00640)  30.77 
 
 
316 aa  103  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.560987 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0577  dehydratase  30.22 
 
 
283 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7330  MaoC-like dehydratase  30.96 
 
 
291 aa  99.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881634  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2580  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  35.58 
 
 
289 aa  94.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1830  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  26.67 
 
 
290 aa  77  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.288038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  30.27 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1760  MaoC domain protein dehydratase  30.77 
 
 
284 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  29.76 
 
 
279 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2677  dehydratase  35 
 
 
135 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0345161 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2779  MaoC domain protein dehydratase  37.5 
 
 
135 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  37.5 
 
 
146 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2872  MaoC domain protein dehydratase  37.5 
 
 
135 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43519  predicted protein  23.3 
 
 
361 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1689  MaoC domain protein dehydratase  30 
 
 
284 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0315419  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2189  MaoC-like dehydratase  27.12 
 
 
284 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  37.25 
 
 
131 aa  42.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0013  dehydratase  40.48 
 
 
154 aa  42.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3371  MaoC domain-containing protein  36.92 
 
 
141 aa  42.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3812  putative dehydratase  40.54 
 
 
156 aa  42  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>