More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3847 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3847  dehydratase  100 
 
 
156 aa  323  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4059  dehydratase  96.79 
 
 
156 aa  315  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4552  MaoC domain protein dehydratase  96.79 
 
 
156 aa  314  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228955  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1337  dehydratase  96.79 
 
 
156 aa  314  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4100  MaoC-like domain protein  86.75 
 
 
173 aa  279  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3838  MaoC-like dehydratase  86.75 
 
 
156 aa  279  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4356  MaoC-like dehydratase  88.08 
 
 
156 aa  278  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30160  3-Re enoyl-CoA hydratase PhaJ  79.74 
 
 
156 aa  260  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1493  dehydratase  70.86 
 
 
156 aa  238  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0447243  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21310  hypothetical protein  65.56 
 
 
156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288859  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1822  hypothetical protein  64.9 
 
 
156 aa  207  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1594  dehydratase  55.32 
 
 
161 aa  170  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.691822  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3886  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  44.23 
 
 
464 aa  141  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271652  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1596  MaoC domain protein dehydratase  47.52 
 
 
149 aa  140  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.733518  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1955  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  46.43 
 
 
472 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435715  normal  0.221917 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1286  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  45.58 
 
 
467 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3315  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  43.59 
 
 
470 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.745735 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0145  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  45.58 
 
 
467 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.880803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1058  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  45.58 
 
 
467 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1255  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  48.95 
 
 
473 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2655  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  45.58 
 
 
467 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2915  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  48.95 
 
 
473 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2798  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  45.58 
 
 
467 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2693  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  48.25 
 
 
473 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4316  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  46.15 
 
 
481 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4426  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  46.15 
 
 
481 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7293  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  45 
 
 
472 aa  137  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4051  dehydratase  52.63 
 
 
140 aa  137  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46056  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1364  maoC family protein  47.69 
 
 
147 aa  134  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.168458  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1226  maoC family protein  47.69 
 
 
147 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3980  maoC family protein  47.69 
 
 
147 aa  134  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1203  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  47.69 
 
 
147 aa  134  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2215  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  46.81 
 
 
468 aa  134  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2187  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  46.81 
 
 
468 aa  134  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1466  maoC family protein  47.69 
 
 
147 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1326  MaoC family protein  47.69 
 
 
147 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1401  maoC family protein  47.69 
 
 
147 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6351  MaoC-like dehydratase  45.99 
 
 
144 aa  133  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040058  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1227  dehydratase  47.69 
 
 
179 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1425  maoC family protein  47.69 
 
 
147 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1205  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  46.92 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3568  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  49.63 
 
 
500 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0417  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  44.3 
 
 
467 aa  131  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0115  MaoC domain protein dehydratase  43.97 
 
 
141 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.527256  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2202  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  44.9 
 
 
467 aa  131  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.878399 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1039  dehydratase  46.92 
 
 
147 aa  130  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1026  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  43.79 
 
 
472 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1127  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  43.51 
 
 
472 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.345508 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0121  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  44.97 
 
 
476 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0357  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  45.93 
 
 
467 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.465716  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5047  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  44.52 
 
 
471 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1055  dehydratase  44.44 
 
 
144 aa  125  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2974  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  42.38 
 
 
473 aa  124  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.530032  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2098  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  42.03 
 
 
493 aa  124  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0584  dehydratase  45.86 
 
 
180 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3537  MaoC domain-containing protein  44.12 
 
 
139 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2926  putative MaoC-like dehydratase  41.96 
 
 
147 aa  120  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.997708  normal  0.0377556 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1998  MaoC-like dehydratase  43.17 
 
 
184 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6099  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  43.97 
 
 
482 aa  120  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.249001  normal  0.018881 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3444  dehydratase  40.44 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.523272  normal  0.0613814 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0052  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  44.44 
 
 
468 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70674  normal  0.03837 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3753  MaoC domain protein dehydratase  40.44 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1672  MaoC-like dehydratase  44.9 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0444565  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6218  dehydratase  45.31 
 
 
177 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0409  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  41.43 
 
 
480 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.935296  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1355  acyl dehydratase  43.28 
 
 
142 aa  118  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3797  dehydratase  46.46 
 
 
132 aa  117  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6753  dehydratase  38.89 
 
 
156 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.478036  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5194  dehydratase  38.52 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5970  MaoC domain protein dehydratase  38.52 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0874793  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3597  dehydratase  42.65 
 
 
158 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.43263 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1674  MaoC domain-containing protein dehydratase  44.88 
 
 
134 aa  115  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0430305 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3031  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  40.71 
 
 
471 aa  114  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0975  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  40.71 
 
 
472 aa  114  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.700689  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3371  MaoC domain-containing protein  42.65 
 
 
141 aa  114  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3607  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  36.36 
 
 
468 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1081  dehydratase  37.69 
 
 
135 aa  114  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4044  MaoC-like dehydratase  36.5 
 
 
155 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.738131  normal  0.82003 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3364  MaoC-like dehydratase  43.51 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.975509  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2811  dehydratase  44.06 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.894889 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1356  (de)hydratase  39.55 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0980  dehydratase  43.28 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.528408  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2305  MaoC family protein  43.28 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2459  MaoC domain protein dehydratase  46.46 
 
 
211 aa  110  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2195  dehydratase  42.54 
 
 
147 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1468  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  36.6 
 
 
478 aa  110  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150978  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3661  dehydratase  44.85 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.831738  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2964  MaoC-like dehydratase  39.85 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.139293  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2329  MaoC domain protein dehydratase  42.64 
 
 
134 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.676407  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3467  MaoC-like dehydratase  43.8 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.273532  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3642  MaoC domain protein dehydratase  40.44 
 
 
157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.023327 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0611  dehydratase  36.36 
 
 
147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519544  normal  0.134756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2797  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  39.86 
 
 
469 aa  108  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00022761 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0588  MaoC-like dehydratase  39.55 
 
 
147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3284  dehydratase  39.55 
 
 
158 aa  107  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0193  dehydratase  37.8 
 
 
136 aa  106  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0987  MaoC domain protein dehydratase  48.18 
 
 
205 aa  105  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.889012 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2239  dehydratase  40 
 
 
138 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.12703  normal  0.929294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5041  dehydratase  37.78 
 
 
157 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0522475  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1965  maoC family protein  40.62 
 
 
138 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000123748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>