More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0588 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0588  MaoC-like dehydratase  100 
 
 
147 aa  304  3e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2305  MaoC family protein  78.23 
 
 
147 aa  242  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0980  dehydratase  78.23 
 
 
147 aa  242  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.528408  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2926  putative MaoC-like dehydratase  77.55 
 
 
147 aa  239  7.999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.997708  normal  0.0377556 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2195  dehydratase  76.87 
 
 
147 aa  239  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3661  dehydratase  75.51 
 
 
148 aa  228  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.831738  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3364  MaoC-like dehydratase  70.75 
 
 
147 aa  209  7e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.975509  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3467  MaoC-like dehydratase  57.14 
 
 
145 aa  161  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.273532  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6351  MaoC-like dehydratase  53.38 
 
 
144 aa  150  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040058  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6753  dehydratase  54.55 
 
 
156 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.478036  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1596  MaoC domain protein dehydratase  53.33 
 
 
149 aa  147  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.733518  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5194  dehydratase  51.13 
 
 
154 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1672  MaoC-like dehydratase  54.89 
 
 
146 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0444565  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3753  MaoC domain protein dehydratase  49.26 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3444  dehydratase  49.26 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.523272  normal  0.0613814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5970  MaoC domain protein dehydratase  50.38 
 
 
155 aa  143  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0874793  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1055  dehydratase  49.63 
 
 
144 aa  142  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0584  dehydratase  51.15 
 
 
180 aa  140  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1998  MaoC-like dehydratase  47.83 
 
 
184 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3284  dehydratase  52.34 
 
 
158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2811  dehydratase  47.22 
 
 
152 aa  137  7e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.894889 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4051  dehydratase  51.11 
 
 
140 aa  136  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46056  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2964  MaoC-like dehydratase  53.38 
 
 
144 aa  135  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.139293  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1940  MaoC-like dehydratase  46.27 
 
 
146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3597  dehydratase  49.25 
 
 
158 aa  133  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.43263 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3642  MaoC domain protein dehydratase  49.26 
 
 
157 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.023327 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6218  dehydratase  51.16 
 
 
177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0115  MaoC domain protein dehydratase  48.48 
 
 
141 aa  130  5e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.527256  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3031  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  48.89 
 
 
471 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0611  dehydratase  44.12 
 
 
147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519544  normal  0.134756 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3886  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  49.25 
 
 
464 aa  126  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271652  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4426  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  46.32 
 
 
481 aa  126  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4316  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  46.32 
 
 
481 aa  126  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0409  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  47.41 
 
 
480 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.935296  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1255  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  46.32 
 
 
473 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2915  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  46.32 
 
 
473 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1493  dehydratase  46.72 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0447243  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2098  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  43.75 
 
 
493 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3315  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  48.51 
 
 
470 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.745735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4044  MaoC-like dehydratase  43.36 
 
 
155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.738131  normal  0.82003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1955  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  45.93 
 
 
472 aa  124  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435715  normal  0.221917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2482  dehydratase  50 
 
 
150 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895902  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1822  hypothetical protein  45.71 
 
 
156 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21310  hypothetical protein  45.71 
 
 
156 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288859  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2693  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  44.85 
 
 
473 aa  123  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3568  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  50 
 
 
500 aa  122  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2239  dehydratase  50.76 
 
 
138 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.12703  normal  0.929294 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2974  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  44.93 
 
 
473 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.530032  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6099  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  47.41 
 
 
482 aa  120  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.249001  normal  0.018881 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0206  dehydratase  45.74 
 
 
133 aa  120  8e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3838  MaoC-like dehydratase  44.03 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3797  dehydratase  48.44 
 
 
132 aa  118  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3371  MaoC domain-containing protein  42.96 
 
 
141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2202  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  47.41 
 
 
467 aa  117  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.878399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4100  MaoC-like domain protein  44.03 
 
 
173 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3537  MaoC domain-containing protein  45.11 
 
 
139 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5041  dehydratase  49.63 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0522475  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1026  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  45.59 
 
 
472 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1127  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  44.12 
 
 
472 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.345508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7293  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  42.96 
 
 
472 aa  114  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0357  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  45.45 
 
 
467 aa  114  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.465716  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4356  MaoC-like dehydratase  41.61 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5047  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  45.59 
 
 
471 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2797  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  43.38 
 
 
469 aa  111  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00022761 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0417  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  43.75 
 
 
467 aa  111  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2655  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  43.36 
 
 
467 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1058  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  43.36 
 
 
467 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0145  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  43.36 
 
 
467 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.880803  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1286  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  43.36 
 
 
467 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2798  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  43.36 
 
 
467 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0121  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  43.36 
 
 
476 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3596  dehydratase  45.26 
 
 
150 aa  110  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4552  MaoC domain protein dehydratase  39.55 
 
 
156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228955  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1337  dehydratase  39.55 
 
 
156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4059  dehydratase  39.55 
 
 
156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0052  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  42.96 
 
 
468 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70674  normal  0.03837 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3847  dehydratase  39.55 
 
 
156 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1039  dehydratase  41.09 
 
 
147 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2187  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  38.13 
 
 
468 aa  107  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2215  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  38.69 
 
 
468 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1081  dehydratase  39.39 
 
 
135 aa  105  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0193  dehydratase  44.34 
 
 
136 aa  105  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1227  dehydratase  38.76 
 
 
179 aa  103  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1425  maoC family protein  38.76 
 
 
147 aa  102  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1226  maoC family protein  38.76 
 
 
147 aa  102  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1203  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.76 
 
 
147 aa  102  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1205  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.76 
 
 
147 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1326  MaoC family protein  38.76 
 
 
147 aa  102  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1466  maoC family protein  38.76 
 
 
147 aa  102  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1401  maoC family protein  38.76 
 
 
147 aa  102  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1364  maoC family protein  38.76 
 
 
147 aa  102  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.168458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3980  maoC family protein  38.76 
 
 
147 aa  102  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30160  3-Re enoyl-CoA hydratase PhaJ  37.24 
 
 
156 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1355  acyl dehydratase  40.3 
 
 
142 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2329  MaoC domain protein dehydratase  43.59 
 
 
134 aa  101  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.676407  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1468  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  37.5 
 
 
478 aa  100  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150978  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1594  dehydratase  38.69 
 
 
161 aa  100  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.691822  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5578  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  41.67 
 
 
467 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1674  MaoC domain-containing protein dehydratase  38.89 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0430305 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1747  acyl dehydratase  45.38 
 
 
138 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>