146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1597 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_1597  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  100 
 
 
286 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1135  MaoC-like dehydratase  83.92 
 
 
290 aa  477  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5282  MaoC-like dehydratase  57.24 
 
 
285 aa  341  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51160  hypothetical protein  53.19 
 
 
288 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000524092 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0490  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  51.7 
 
 
283 aa  290  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4366  hypothetical protein  52.13 
 
 
288 aa  287  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253028  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3807  putative dehydratase  51.34 
 
 
297 aa  279  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0121  dehydratase  51.01 
 
 
297 aa  276  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0139  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  51.34 
 
 
297 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0195  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  50 
 
 
315 aa  276  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6855  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  47 
 
 
289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5520  acyl dehydratase (MaoC-like domain)  47.22 
 
 
291 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7330  MaoC-like dehydratase  47.74 
 
 
291 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881634  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2580  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  52.46 
 
 
289 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3404  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  39.79 
 
 
286 aa  249  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3386  MaoC-like dehydratase  46.64 
 
 
286 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263784  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3113  MaoC-like dehydratase  41.91 
 
 
286 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107347  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3605  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  42.22 
 
 
286 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.253459  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2352  MaoC-like dehydratase  41.79 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5004  putative dehydratase  40.91 
 
 
286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.133052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5896  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  43.48 
 
 
285 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1180  MaoC-like dehydratase  44.2 
 
 
289 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.637996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1197  dehydratase  44.2 
 
 
289 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.72908  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1207  dehydratase  44.2 
 
 
289 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273063  normal  0.0226898 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1528  dehydratase  40.73 
 
 
288 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 
710 aa  179  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4895  dehydratase  41.37 
 
 
291 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0215667 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5305  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  42.91 
 
 
283 aa  175  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0297084  normal  0.691461 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1518  dehydratase  39.19 
 
 
286 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2677  dehydratase  39.02 
 
 
276 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211797  normal  0.0433405 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3852  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  37.2 
 
 
285 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13571  dehydrogenase  40.34 
 
 
286 aa  166  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000153727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0894  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  37.89 
 
 
287 aa  166  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854145  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4663  MaoC-like dehydratase  37.54 
 
 
286 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4751  dehydratase  37.54 
 
 
286 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5046  dehydratase  37.54 
 
 
286 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5238  dehydratase  37.79 
 
 
286 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.263636 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4199  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  37.99 
 
 
288 aa  159  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13423  dehydrogenase  38.28 
 
 
290 aa  159  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.012910000000001e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3224  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  36.57 
 
 
283 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2885  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  37.98 
 
 
278 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409095  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  37.82 
 
 
893 aa  156  3e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1800  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  38.43 
 
 
282 aa  156  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4033  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  35.07 
 
 
283 aa  149  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2781  dehydratase  36.3 
 
 
282 aa  142  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  36.67 
 
 
903 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0577  dehydratase  35.04 
 
 
283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02577  peroxisomal dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00640)  33.33 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.560987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3478  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  32.33 
 
 
265 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2346  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00138691  normal  0.0743617 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09041  conserved hypothetical protein  29 
 
 
295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.238331  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  29.3 
 
 
901 aa  112  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1830  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  30.57 
 
 
290 aa  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.288038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  31.48 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  30.18 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  40.24 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2779  MaoC domain protein dehydratase  40.24 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2677  dehydratase  44.93 
 
 
135 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0345161 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03381  conserved hypothetical protein  26.7 
 
 
1872 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.888019  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2872  MaoC domain protein dehydratase  40.24 
 
 
135 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2189  MaoC-like dehydratase  30.98 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1760  MaoC domain protein dehydratase  28.96 
 
 
284 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0580  MaoC-like dehydratase  26.69 
 
 
317 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  31.58 
 
 
137 aa  55.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1689  MaoC domain protein dehydratase  28.96 
 
 
284 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0315419  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43519  predicted protein  22.93 
 
 
361 aa  53.1  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0206  dehydratase  32.5 
 
 
133 aa  53.1  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  32.41 
 
 
154 aa  52.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  27.98 
 
 
337 aa  52.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  33.85 
 
 
141 aa  52.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07873  fatty acid synthase beta subunit, putative (JCVI)  36 
 
 
2111 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.826849  normal  0.601951 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  37.76 
 
 
144 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  34.04 
 
 
141 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0994  dehydrogenase  34.72 
 
 
134 aa  49.7  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0580228  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1356  (de)hydratase  31.43 
 
 
141 aa  49.3  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2748  MaoC domain protein dehydratase  35.63 
 
 
140 aa  49.3  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.149372  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04370  fatty-acid synthase complex protein, putative  27.97 
 
 
2513 aa  48.5  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0195236  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3648  fatty acid synthase  30.22 
 
 
3077 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3721  fatty acid synthase  30.22 
 
 
3077 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.875058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3661  fatty acid synthase  30.22 
 
 
3075 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.23097 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  36.67 
 
 
131 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  33.65 
 
 
150 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1081  dehydratase  28.74 
 
 
135 aa  47.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  28.46 
 
 
138 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  28.46 
 
 
138 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  28.46 
 
 
138 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03008  MaoC domain protein dehydratase  26.26 
 
 
291 aa  46.6  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104203  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0908  dehydratase  32.11 
 
 
155 aa  47  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  35 
 
 
142 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4100  MaoC-like domain protein  34.78 
 
 
173 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10649  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  33.33 
 
 
142 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0228319 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2202  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  28.7 
 
 
467 aa  46.2  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.878399 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3838  MaoC-like dehydratase  34.78 
 
 
156 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4356  MaoC-like dehydratase  33.7 
 
 
156 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2692  MaoC domain protein dehydratase  36.99 
 
 
142 aa  46.2  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4552  MaoC domain protein dehydratase  38.03 
 
 
156 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228955  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1337  dehydratase  38.03 
 
 
156 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4059  dehydratase  38.03 
 
 
156 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3031  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  34.52 
 
 
471 aa  45.8  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21390  acyl dehydratase  35 
 
 
157 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000515647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>