123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3807 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_3807  putative dehydratase  100 
 
 
297 aa  601  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0121  dehydratase  86.87 
 
 
297 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0195  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  82.83 
 
 
315 aa  504  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0139  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  84.85 
 
 
297 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5282  MaoC-like dehydratase  52.53 
 
 
285 aa  301  7.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1135  MaoC-like dehydratase  51.34 
 
 
290 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1597  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  50 
 
 
286 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4366  hypothetical protein  51.19 
 
 
288 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253028  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6855  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  50 
 
 
289 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7330  MaoC-like dehydratase  49.66 
 
 
291 aa  262  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881634  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51160  hypothetical protein  49.49 
 
 
288 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000524092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5520  acyl dehydratase (MaoC-like domain)  44.78 
 
 
291 aa  254  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0490  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  41.78 
 
 
283 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2580  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  49.66 
 
 
289 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3404  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  42.37 
 
 
286 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3386  MaoC-like dehydratase  38.64 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263784  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3113  MaoC-like dehydratase  40.22 
 
 
286 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107347  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3605  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  36.95 
 
 
286 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.253459  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2352  MaoC-like dehydratase  38.41 
 
 
286 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5004  putative dehydratase  38.33 
 
 
286 aa  175  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.133052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1800  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  39.31 
 
 
282 aa  162  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5896  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  39.42 
 
 
285 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4895  dehydratase  39.78 
 
 
291 aa  159  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0215667 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5305  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  41.2 
 
 
283 aa  158  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0297084  normal  0.691461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4199  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  39.93 
 
 
288 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2677  dehydratase  39.71 
 
 
276 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211797  normal  0.0433405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1518  dehydratase  35.03 
 
 
286 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13423  dehydrogenase  38.89 
 
 
290 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.012910000000001e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2885  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  39.34 
 
 
278 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409095  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5238  dehydratase  34.69 
 
 
286 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.263636 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13571  dehydrogenase  36.3 
 
 
286 aa  145  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000153727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1528  dehydratase  38.49 
 
 
288 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3852  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  37.55 
 
 
285 aa  145  9e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1180  MaoC-like dehydratase  36.33 
 
 
289 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.637996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1197  dehydratase  36.33 
 
 
289 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.72908  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4663  MaoC-like dehydratase  35.19 
 
 
286 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4751  dehydratase  35.19 
 
 
286 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5046  dehydratase  35.19 
 
 
286 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1207  dehydratase  36 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273063  normal  0.0226898 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  34.49 
 
 
893 aa  138  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
710 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0894  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  35.84 
 
 
287 aa  136  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854145  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2781  dehydratase  36.8 
 
 
282 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  35.05 
 
 
903 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  31.79 
 
 
901 aa  120  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02577  peroxisomal dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00640)  31.7 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.560987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3478  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  34.63 
 
 
265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2346  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  34.36 
 
 
283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00138691  normal  0.0743617 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1830  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  29.75 
 
 
290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.288038 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3224  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  30.65 
 
 
283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4033  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  29.17 
 
 
283 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0577  dehydratase  28.78 
 
 
283 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09041  conserved hypothetical protein  34.04 
 
 
295 aa  102  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.238331  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  30.36 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  32.97 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  30.15 
 
 
337 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0580  MaoC-like dehydratase  25.81 
 
 
317 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03381  conserved hypothetical protein  35.24 
 
 
1872 aa  55.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.888019  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2677  dehydratase  40 
 
 
135 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0345161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  35.88 
 
 
141 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2779  MaoC domain protein dehydratase  35.79 
 
 
135 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2872  MaoC domain protein dehydratase  35.79 
 
 
135 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  41.79 
 
 
146 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3648  fatty acid synthase  32 
 
 
3077 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3721  fatty acid synthase  32 
 
 
3077 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.875058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3661  fatty acid synthase  32 
 
 
3075 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.23097 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07873  fatty acid synthase beta subunit, putative (JCVI)  41.43 
 
 
2111 aa  53.9  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.826849  normal  0.601951 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0858  putative dehydratase  37.21 
 
 
127 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586377  normal  0.419357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2532  dehydratase  29.73 
 
 
3087 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  25.59 
 
 
335 aa  52.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4125  dehydratase  30.41 
 
 
3097 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  35.06 
 
 
156 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1356  (de)hydratase  27.62 
 
 
141 aa  50.1  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2748  MaoC domain protein dehydratase  34.48 
 
 
140 aa  50.1  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.149372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  35.71 
 
 
151 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0370  MaoC domain protein dehydratase  37.65 
 
 
130 aa  49.7  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.758804 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1039  dehydratase  26.27 
 
 
147 aa  49.7  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  34.21 
 
 
148 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  39.53 
 
 
137 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1355  acyl dehydratase  28.57 
 
 
142 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1760  MaoC domain protein dehydratase  29.03 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3812  MaoC-like dehydratase  37.5 
 
 
140 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0106778  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12545  fatty acid synthase fas  32.09 
 
 
3069 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.696473  decreased coverage  0.00343939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1998  MaoC-like dehydratase  28.07 
 
 
184 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  29.35 
 
 
145 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2239  dehydratase  30.97 
 
 
138 aa  46.6  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.12703  normal  0.929294 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3537  MaoC domain-containing protein  28.04 
 
 
139 aa  45.8  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  31.96 
 
 
147 aa  45.8  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  27.59 
 
 
148 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  44.07 
 
 
131 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  26.51 
 
 
148 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2926  putative MaoC-like dehydratase  33.68 
 
 
147 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.997708  normal  0.0377556 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  29.87 
 
 
152 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2305  MaoC family protein  31.33 
 
 
147 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0161  MaoC domain protein dehydratase  33.82 
 
 
140 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.49242  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  39.71 
 
 
150 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3661  dehydratase  27.78 
 
 
148 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.831738  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0980  dehydratase  31.33 
 
 
147 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.528408  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2195  dehydratase  31.33 
 
 
147 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21390  acyl dehydratase  38.98 
 
 
157 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000515647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>