151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2666 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  310  4.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  66.44 
 
 
149 aa  202  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  60.96 
 
 
145 aa  188  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  54.05 
 
 
148 aa  168  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  55.1 
 
 
147 aa  160  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  53.38 
 
 
149 aa  155  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  47.97 
 
 
148 aa  151  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  46.62 
 
 
156 aa  147  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0898  hypothetical protein  50.69 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.246332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  48.65 
 
 
148 aa  145  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  49.66 
 
 
153 aa  144  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6647  hypothetical protein  49.32 
 
 
148 aa  139  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  46.98 
 
 
151 aa  136  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  43.84 
 
 
149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  42.76 
 
 
147 aa  128  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0288  hypothetical protein  45.45 
 
 
145 aa  123  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3027  hypothetical protein  41.29 
 
 
157 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  41.45 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0562  hypothetical protein  39.24 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0892456  normal  0.0661028 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07680  hypothetical protein  39.75 
 
 
167 aa  114  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0469422 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  39.33 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2693  MaoC domain protein dehydratase  39.31 
 
 
150 aa  108  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3183  MaoC domain protein dehydratase  35.42 
 
 
151 aa  104  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21400  acyl dehydratase  38.3 
 
 
149 aa  102  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0000186279  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21190  acyl dehydratase  38.24 
 
 
180 aa  100  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0664  hypothetical protein  38.51 
 
 
153 aa  99.8  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00923819  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  40.14 
 
 
144 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0599  MaoC-like dehydratase  39.86 
 
 
153 aa  95.1  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598373  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  39.46 
 
 
144 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  39.46 
 
 
144 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2840  MaoC domain protein dehydratase  35.62 
 
 
146 aa  89  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0673  MaoC-like dehydratase  32.87 
 
 
177 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0686  dehydratase  32.87 
 
 
177 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.169172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0666  dehydratase  32.87 
 
 
177 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  35.86 
 
 
147 aa  87.4  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6365  hypothetical protein  36.3 
 
 
133 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937275  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1232  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  31.47 
 
 
177 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0390  MaoC-like dehydratase  37.41 
 
 
145 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000306687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0670  hypothetical protein  33.56 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0367273  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  35.42 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  35.42 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5119  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  30.77 
 
 
185 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0842  MaoC-like dehydratase  31.58 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.659825  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  34.72 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5121  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  28.76 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10648  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  27.59 
 
 
158 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.039671 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0663  hypothetical protein  34.11 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595218  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10515  hypothetical protein  34.56 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
339 aa  77.8  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0070  MaoC-like dehydratase  29.8 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112282  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4084  hypothetical protein  30.15 
 
 
185 aa  77  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4168  hypothetical protein  36.8 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  31.88 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0946  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  29.25 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0918  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  30.07 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0669251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0935  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  30.07 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  37.07 
 
 
335 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2678  hypothetical protein  28.3 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0349464 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4070  hypothetical protein  34.93 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  33.06 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  31.62 
 
 
343 aa  73.9  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0920  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  28.67 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117088  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  32.65 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0937  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  28.67 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  27.78 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1609  hypothetical protein  29.93 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0948  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  28.67 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1778  hypothetical protein  38.04 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  30.15 
 
 
343 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  30.15 
 
 
343 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1230  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  27.45 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  30.15 
 
 
343 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  33.11 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2496  hypothetical protein  38.04 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2528  hypothetical protein  32.82 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4756  hypothetical protein  33.6 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5026  hypothetical protein  34.4 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000215714  normal  0.277815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  30.15 
 
 
343 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3813  hypothetical protein  30.4 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0202371  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10650  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  27.27 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0506433 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  31.97 
 
 
337 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0738  MaoC domain protein dehydratase  31.69 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4077  hypothetical protein  28.77 
 
 
148 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3723  hypothetical protein  30.41 
 
 
148 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0448  hypothetical protein  30.51 
 
 
170 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423979  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2687  hypothetical protein  31.01 
 
 
158 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3987  hypothetical protein  29.63 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2780  hypothetical protein  30.38 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.189937  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3212  MaoC-like dehydratase  31.34 
 
 
152 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3274  dehydratase  31.34 
 
 
152 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3223  dehydratase  31.34 
 
 
152 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2873  hypothetical protein  30.13 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  28.26 
 
 
324 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  27.56 
 
 
279 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  30.23 
 
 
297 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4069  hypothetical protein  35.71 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.389962  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2939  hypothetical protein  27.52 
 
 
150 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  33.33 
 
 
317 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  30.95 
 
 
317 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  27.74 
 
 
322 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>