198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0858 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0858  putative dehydratase  100 
 
 
127 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586377  normal  0.419357 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1081  dehydratase  35.53 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2346  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 
283 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00138691  normal  0.0743617 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2748  MaoC domain protein dehydratase  42.25 
 
 
140 aa  57.8  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.149372  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0292  Enoyl-CoA hydratase  42.7 
 
 
162 aa  57.4  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000103389  hitchhiker  0.0000892169 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1356  (de)hydratase  33.33 
 
 
141 aa  57  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0161  MaoC domain protein dehydratase  35.09 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.49242  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  44.87 
 
 
279 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4051  dehydratase  39.73 
 
 
140 aa  52.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46056  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1753  dehydratase  31.01 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.674213  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 
620 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5282  MaoC-like dehydratase  33.33 
 
 
285 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2239  dehydratase  39.44 
 
 
138 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.12703  normal  0.929294 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0121  dehydratase  44.62 
 
 
297 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0262  MaoC domain protein dehydratase  35.96 
 
 
314 aa  50.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  37.04 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0195  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  39.74 
 
 
315 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0206  dehydratase  35.44 
 
 
133 aa  50.4  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4817  MaoC domain-containing protein  38.61 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4982  MaoC-like dehydratase  34.65 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310652  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1858  Enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0611  dehydratase  30.34 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519544  normal  0.134756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5194  dehydratase  37.78 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5970  MaoC domain protein dehydratase  38.2 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0874793  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4127  dehydratase  34.18 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2459  MaoC domain protein dehydratase  39.73 
 
 
211 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2738  MaoC domain protein dehydratase  41.54 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00396042 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4692  dehydratase  40.66 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3256  MaoC domain protein dehydratase  29.31 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  33.82 
 
 
893 aa  48.5  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0604  dehydratase  37.62 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3753  MaoC domain protein dehydratase  39.53 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3642  MaoC domain protein dehydratase  39.76 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.023327 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1355  acyl dehydratase  26.97 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  42.86 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3444  dehydratase  39.53 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.523272  normal  0.0613814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1822  hypothetical protein  35.71 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0193  dehydratase  33.33 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11910  hypothetical protein  40.23 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0480105  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  37.33 
 
 
901 aa  47.8  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1094  hypothetical protein  40.23 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00316443  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5041  dehydratase  39.02 
 
 
157 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0522475  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2751  MaoC domain protein dehydratase  31.65 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84456  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1444  MaoC-like dehydratase  33.33 
 
 
162 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0821742  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0139  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  40 
 
 
297 aa  47.4  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1040  MaoC domain protein dehydratase  35.24 
 
 
219 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  33.94 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4374  dehydratase  37.04 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4895  dehydratase  37.04 
 
 
291 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0215667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3404  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  31.11 
 
 
286 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  41.79 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0635  MaoC-like dehydratase  36.9 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2482  dehydratase  36.59 
 
 
150 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895902  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30160  3-Re enoyl-CoA hydratase PhaJ  44 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03008  MaoC domain protein dehydratase  31.63 
 
 
291 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104203  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4076  MaoC-like dehydratase  28.7 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1998  MaoC-like dehydratase  31.43 
 
 
184 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1751  MaoC-like dehydratase  37.18 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0260343  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2811  dehydratase  35.16 
 
 
152 aa  45.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.894889 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  34.78 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21310  hypothetical protein  34.29 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288859  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1798  dehydratase  37.18 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1970  dehydratase  37.18 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1732  dehydratase  37.18 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  30.51 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3180  MaoC-like dehydratase  31.4 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3189  putative nodulation-related acyl dehydratase, MaoC/NodN-like  33.61 
 
 
158 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0987  MaoC domain protein dehydratase  36.99 
 
 
205 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.889012 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4870  dehydratase  36.63 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0588  MaoC-like dehydratase  29.52 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4366  hypothetical protein  39.71 
 
 
288 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253028  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4251  MaoC domain protein dehydratase  36.99 
 
 
220 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0316  dehydratase  29.27 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416674  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3533  MaoC domain protein dehydratase  26.67 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  36.45 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2580  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  45.71 
 
 
289 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  29.35 
 
 
903 aa  44.3  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3364  MaoC-like dehydratase  28.04 
 
 
147 aa  44.3  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.975509  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0994  dehydrogenase  30.77 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0580228  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3596  dehydratase  35.63 
 
 
150 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1577  dehydratase  30.48 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0775031  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3353  MaoC domain protein dehydratase  35.63 
 
 
161 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2956  MaoC domain protein dehydratase  30.34 
 
 
148 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13048  predicted acyl dehydratase  28.17 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.620286  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1571  MaoC-like dehydratase  38.37 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745995  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0580  MaoC-like dehydratase  29.81 
 
 
317 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1800  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  34.88 
 
 
282 aa  43.9  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3940  dehydratase  42.42 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3583  nodN-like protein  36.84 
 
 
159 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.234832 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3206  MaoC-like dehydratase  39.47 
 
 
166 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16780  acyl dehydratase  35.58 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3031  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  31.43 
 
 
471 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4059  dehydratase  35.71 
 
 
156 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4552  MaoC domain protein dehydratase  35.71 
 
 
156 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228955  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03560  acyl dehydratase  33.33 
 
 
133 aa  43.5  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.210712  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2249  MaoC-like dehydratase  39.47 
 
 
154 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.135818 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0115  MaoC domain protein dehydratase  31.94 
 
 
141 aa  43.5  0.0009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.527256  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1337  dehydratase  35.71 
 
 
156 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1596  MaoC domain protein dehydratase  32.22 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.733518  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51160  hypothetical protein  38.24 
 
 
288 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000524092 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>