277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3940 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3940  dehydratase  100 
 
 
130 aa  260  6e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4332  dehydratase  96.15 
 
 
130 aa  251  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  65.08 
 
 
142 aa  166  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  64.8 
 
 
155 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  60.94 
 
 
141 aa  160  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03560  acyl dehydratase  60.16 
 
 
133 aa  159  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.210712  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  60.32 
 
 
142 aa  155  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  58.46 
 
 
142 aa  151  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  57.81 
 
 
139 aa  149  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  57.94 
 
 
141 aa  149  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  55.56 
 
 
142 aa  147  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  56.35 
 
 
142 aa  147  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6065  dehydratase  54.76 
 
 
142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  57.94 
 
 
141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1010  MaoC domain protein dehydratase  57.94 
 
 
143 aa  142  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2692  MaoC domain protein dehydratase  57.03 
 
 
142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  53.44 
 
 
150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0742  MaoC-like dehydratase  53.17 
 
 
142 aa  136  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0921523  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2738  MaoC domain protein dehydratase  51.91 
 
 
145 aa  134  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00396042 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  54.76 
 
 
127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  54.47 
 
 
144 aa  124  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10649  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  47.24 
 
 
142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0228319 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  48.41 
 
 
154 aa  114  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  51.16 
 
 
138 aa  114  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3182  MaoC domain protein dehydratase  49.62 
 
 
143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0456076 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  51.59 
 
 
131 aa  110  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0739  MaoC domain protein dehydratase  41.73 
 
 
141 aa  104  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0563  MaoC domain protein dehydratase  51.24 
 
 
144 aa  102  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.127994  normal  0.0650042 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17510  acyl dehydratase  48.2 
 
 
163 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.736026  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21390  acyl dehydratase  47.29 
 
 
157 aa  102  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000515647  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  44.53 
 
 
339 aa  100  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5120  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  49.21 
 
 
142 aa  99  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1231  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  48.03 
 
 
142 aa  99  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  42.64 
 
 
343 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  42.64 
 
 
343 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0600  MaoC domain protein dehydratase  48 
 
 
142 aa  98.2  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.552837  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  42.64 
 
 
343 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0919  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  47.58 
 
 
142 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0891029  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0936  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  47.58 
 
 
142 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  40.31 
 
 
343 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  41.41 
 
 
343 aa  93.6  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0947  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  46.77 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  39.53 
 
 
352 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1777  MaoC domain protein dehydratase  40.68 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  39.68 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0161  MaoC domain protein dehydratase  50 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.49242  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2497  MaoC domain protein dehydratase  39.83 
 
 
134 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  41.59 
 
 
151 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  41.67 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  37.93 
 
 
337 aa  71.2  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  38.39 
 
 
335 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  40.95 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  39.47 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  39.47 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  39.47 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0258  dehydratase  40.4 
 
 
284 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.115215 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0157  dehydratase  41.57 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  35.71 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0413  dehydratase  45.33 
 
 
282 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0697277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0239  MaoC-like dehydratase  41.38 
 
 
281 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0229  dehydratase  41.38 
 
 
281 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0249  dehydratase  41.38 
 
 
281 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10244  hypothetical protein  45.33 
 
 
280 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0093701  normal  0.943124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3988  dehydratase  48.28 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  45.45 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  37.07 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  37.07 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  47.14 
 
 
279 aa  58.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03008  MaoC domain protein dehydratase  33.66 
 
 
291 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104203  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  34.75 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2527  MaoC-like dehydratase  33.9 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5027  putative acyl dehydratase  41.89 
 
 
138 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000226168  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0664  MaoC domain-containing protein  37.76 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0426  MaoC domain protein dehydratase  51.52 
 
 
294 aa  57  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.252327  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0498  dehydratase  40.98 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.14206  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  42.11 
 
 
297 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5770  MaoC domain protein dehydratase  41.33 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4076  MaoC-like dehydratase  34.02 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3284  dehydratase  33.33 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3812  MaoC-like dehydratase  34.02 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0106778  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3587  MaoC domain protein dehydratase  43.04 
 
 
311 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1055  dehydratase  34.21 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4069  dehydratase  37.3 
 
 
141 aa  53.9  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2727  putative MaoC-like dehydratase  40.91 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85125  Fatty acid synthase subunit beta Includes: 3-hydroxypalmitoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase; Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]; [Acyl-carrier-protein] acetyltransferase; [Acyl-carrier-protein] malonyltransferase; S-acyl fatty acid synthase thioesterase  40.79 
 
 
2075 aa  53.9  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4169  MaoC-like dehydratase  39.39 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116288  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2677  dehydratase  34.51 
 
 
135 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0345161 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0643  MaoC-like dehydratase  43.28 
 
 
286 aa  52  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3724  MaoC domain protein dehydratase  34.02 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1674  MaoC domain protein dehydratase  40.3 
 
 
314 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6753  dehydratase  28.57 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.478036  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2776  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  40.3 
 
 
311 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272996  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2811  dehydratase  34.83 
 
 
152 aa  51.6  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.894889 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_463  acyl dehydratase  32.89 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3597  dehydratase  31.4 
 
 
158 aa  51.6  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.43263 
 
 
-
 
NC_002936  DET0522  hypothetical protein  32.89 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000722837  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2956  MaoC domain protein dehydratase  35.71 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6351  MaoC-like dehydratase  32.97 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040058  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0115  MaoC domain protein dehydratase  30.16 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.527256  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3115  MaoC domain protein dehydratase  40 
 
 
333 aa  50.8  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>