255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5770 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_5770  MaoC domain protein dehydratase  100 
 
 
149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5027  putative acyl dehydratase  57.35 
 
 
138 aa  167  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000226168  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  61.36 
 
 
138 aa  163  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4169  MaoC-like dehydratase  55.71 
 
 
138 aa  161  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116288  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2527  MaoC-like dehydratase  56.06 
 
 
139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  53.57 
 
 
141 aa  156  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2727  putative MaoC-like dehydratase  53.03 
 
 
138 aa  156  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  55.22 
 
 
139 aa  153  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0664  MaoC domain-containing protein  53.03 
 
 
137 aa  152  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4076  MaoC-like dehydratase  53.17 
 
 
137 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3988  dehydratase  51.91 
 
 
136 aa  139  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0157  dehydratase  50.37 
 
 
137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3812  MaoC-like dehydratase  52.76 
 
 
140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0106778  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  51.88 
 
 
138 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  51.88 
 
 
138 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  51.88 
 
 
138 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3724  MaoC domain protein dehydratase  49.64 
 
 
141 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4069  dehydratase  51.15 
 
 
141 aa  133  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  48.06 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0161  MaoC domain protein dehydratase  39.34 
 
 
140 aa  94.7  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.49242  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2497  MaoC domain protein dehydratase  34.38 
 
 
134 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1777  MaoC domain protein dehydratase  32.06 
 
 
133 aa  88.6  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0391  dehydratase  35.38 
 
 
322 aa  88.6  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  37.41 
 
 
141 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  37.41 
 
 
141 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  37.41 
 
 
141 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4180  MaoC domain protein dehydratase  38.52 
 
 
332 aa  86.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128585  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4153  MaoC domain protein dehydratase  38.52 
 
 
332 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0742  MaoC-like dehydratase  39.45 
 
 
142 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0921523  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4037  MaoC-like dehydratase  37.7 
 
 
326 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  38.06 
 
 
151 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  33.59 
 
 
335 aa  80.5  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  41.67 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  41.05 
 
 
337 aa  78.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6065  dehydratase  43.59 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  38.02 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  37.96 
 
 
142 aa  77  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  37.96 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  40.46 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  38.32 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  39.32 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  39.32 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0498  dehydratase  31.86 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.14206  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  35.88 
 
 
339 aa  67.8  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03560  acyl dehydratase  38.85 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.210712  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1998  MaoC-like dehydratase  34.45 
 
 
184 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  37.04 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10649  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  38.04 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0228319 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0115  MaoC domain protein dehydratase  31.09 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.527256  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  36.22 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17510  acyl dehydratase  36.13 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.736026  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3994  MaoC-like dehydratase  30.14 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.270876 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  36.52 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1221  MaoC domain protein dehydratase  34.13 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0229542 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  36.23 
 
 
138 aa  63.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  39.56 
 
 
343 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  39.56 
 
 
343 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  30.67 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  39.56 
 
 
343 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  43.24 
 
 
343 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_002936  DET0522  hypothetical protein  30.97 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000722837  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  46.48 
 
 
141 aa  61.6  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6351  MaoC-like dehydratase  32.09 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040058  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2738  MaoC domain protein dehydratase  31.45 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00396042 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_463  acyl dehydratase  30.97 
 
 
137 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1010  MaoC domain protein dehydratase  38.37 
 
 
143 aa  60.8  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3031  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  36.13 
 
 
471 aa  60.8  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  38.1 
 
 
343 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4426  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  35.65 
 
 
481 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4316  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  35.65 
 
 
481 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6753  dehydratase  30.6 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.478036  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  41.77 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  34.25 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5120  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  38.04 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0947  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  36.45 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1231  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  38.04 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0287  dehydratase  32.77 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2215  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.91 
 
 
468 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2187  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.91 
 
 
468 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2677  dehydratase  36.7 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0345161 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1596  MaoC domain protein dehydratase  32.76 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.733518  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1822  hypothetical protein  31.3 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1356  (de)hydratase  28.95 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21310  hypothetical protein  30.43 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288859  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4070  dehydratase  31.62 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.353484  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2098  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32.17 
 
 
493 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2378  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.81 
 
 
469 aa  57.4  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127977 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1127  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.04 
 
 
472 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.345508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  46.91 
 
 
131 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1255  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  34.78 
 
 
473 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3886  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.61 
 
 
464 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271652  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0919  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  35.87 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0891029  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0611  dehydratase  35.14 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519544  normal  0.134756 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3940  dehydratase  41.33 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0936  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  35.87 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3537  MaoC domain-containing protein  32.52 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3315  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.61 
 
 
470 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.745735 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0975  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.63 
 
 
472 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.700689  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1055  dehydratase  35.48 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2811  dehydratase  32.53 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.894889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>