183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1608 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  100 
 
 
141 aa  290  6e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2727  putative MaoC-like dehydratase  59.56 
 
 
138 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  60 
 
 
139 aa  170  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4169  MaoC-like dehydratase  57.35 
 
 
138 aa  168  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116288  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5027  putative acyl dehydratase  55.56 
 
 
138 aa  168  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000226168  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  55.88 
 
 
138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2527  MaoC-like dehydratase  54.89 
 
 
139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  56.2 
 
 
138 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  56.2 
 
 
138 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  56.2 
 
 
138 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5770  MaoC domain protein dehydratase  53.57 
 
 
149 aa  156  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  56.35 
 
 
141 aa  152  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0664  MaoC domain-containing protein  53.38 
 
 
137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3812  MaoC-like dehydratase  52.14 
 
 
140 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0106778  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4076  MaoC-like dehydratase  55.47 
 
 
137 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3724  MaoC domain protein dehydratase  50.36 
 
 
141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3988  dehydratase  53.03 
 
 
136 aa  142  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0157  dehydratase  53.91 
 
 
137 aa  140  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4069  dehydratase  47.48 
 
 
141 aa  127  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2497  MaoC domain protein dehydratase  35.66 
 
 
134 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0742  MaoC-like dehydratase  38.62 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0921523  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0391  dehydratase  34.38 
 
 
322 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  32.85 
 
 
141 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  32.85 
 
 
141 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  32.85 
 
 
141 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4153  MaoC domain protein dehydratase  36.57 
 
 
332 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4180  MaoC domain protein dehydratase  36.57 
 
 
332 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128585  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4037  MaoC-like dehydratase  36.57 
 
 
326 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  39.69 
 
 
151 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  39.31 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1777  MaoC domain protein dehydratase  31.3 
 
 
133 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  36.49 
 
 
141 aa  83.6  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0161  MaoC domain protein dehydratase  35.83 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.49242  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  32.84 
 
 
335 aa  77.4  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03560  acyl dehydratase  40 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.210712  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  35.21 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  40.87 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  40.14 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  35.66 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  40.32 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  50.72 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  38.28 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6065  dehydratase  34.48 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  33.33 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  40 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  45.21 
 
 
343 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10649  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  34.07 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0228319 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  44.44 
 
 
343 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  44.44 
 
 
343 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  44.44 
 
 
343 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1010  MaoC domain protein dehydratase  41.33 
 
 
143 aa  63.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3480  MaoC domain protein dehydratase  31.91 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  36.09 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2738  MaoC domain protein dehydratase  31.76 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00396042 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  31.08 
 
 
150 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0498  dehydratase  30.15 
 
 
137 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.14206  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  30.77 
 
 
337 aa  60.5  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3940  dehydratase  45.45 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17510  acyl dehydratase  33.67 
 
 
163 aa  58.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.736026  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  35.78 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4332  dehydratase  45.45 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0062  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3182  MaoC domain protein dehydratase  36.89 
 
 
143 aa  57  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0456076 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1221  MaoC domain protein dehydratase  30.47 
 
 
148 aa  57  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0229542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  39.24 
 
 
343 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0563  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.127994  normal  0.0650042 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_463  acyl dehydratase  29.41 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3994  MaoC-like dehydratase  25.87 
 
 
151 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.270876 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  38.27 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21390  acyl dehydratase  39.68 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000515647  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0739  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5359  MaoC domain protein dehydratase  36.15 
 
 
158 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0600  MaoC domain protein dehydratase  37.65 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.552837  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  32.63 
 
 
297 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4426  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.58 
 
 
481 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  33.01 
 
 
339 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3209  MaoC-like dehydratase  28.68 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205501  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4559  hypothetical protein  33.33 
 
 
412 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3271  dehydratase  28.68 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3220  dehydratase  28.68 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216519  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  32.5 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4316  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.58 
 
 
481 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2692  MaoC domain protein dehydratase  33.59 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0522  hypothetical protein  29.41 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000722837  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0287  dehydratase  28.7 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1231  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  33.33 
 
 
142 aa  52  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  42.37 
 
 
279 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3812  putative dehydratase  33.33 
 
 
156 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0031  dehydratase  30.15 
 
 
160 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.109273  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4070  dehydratase  34.23 
 
 
147 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.353484  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5120  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  35.07 
 
 
142 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0919  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  34.56 
 
 
142 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0891029  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0936  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  34.56 
 
 
142 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0947  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  35.07 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1040  MaoC domain protein dehydratase  27.14 
 
 
219 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  37.86 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  31.3 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1800  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  30.93 
 
 
282 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0512  hypothetical protein  27.93 
 
 
326 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1483  hypothetical protein  24.8 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000382942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>