47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0512 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0512  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  676    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3210  hypothetical protein  29.76 
 
 		 175 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.342499  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3272  hypothetical protein  29.76 
 
 		 175 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3221  hypothetical protein  29.76 
 
 		 175 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.771398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5358  hypothetical protein  34.15 
 
 		 179 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3209  MaoC-like dehydratase  35 
 
 		 156 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205501  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3271  dehydratase  35 
 
 		 156 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3220  dehydratase  35 
 
 		 156 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  28.17 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8195  dehydratase  30.08 
 
 		 136 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  29.32 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3480  MaoC domain protein dehydratase  32.76 
 
 		 143 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1483  hypothetical protein  28.95 
 
 		 152 aa  54.3  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000382942  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  32 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  32.28 
 
 		 312 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1852  hypothetical protein  26.32 
 
 		 178 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2140  dehydratase  31.46 
 
 		 148 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  27.93 
 
 		 141 aa  50.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3274  dehydratase  26.71 
 
 		 152 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3212  MaoC-like dehydratase  26.71 
 
 		 152 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3223  dehydratase  26.71 
 
 		 152 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0059  hypothetical protein  29.73 
 
 		 173 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  20.36 
 
 		 335 aa  49.3  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  26.21 
 
 		 149 aa  49.3  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0062  MaoC domain protein dehydratase  30.33 
 
 		 133 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  28.93 
 
 		 148 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2622  hypothetical protein  29.91 
 
 		 129 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0241614  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0663  hypothetical protein  31.3 
 
 		 146 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595218  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  28.47 
 
 		 151 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  27.4 
 
 		 149 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1853  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0381844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  29.2 
 
 		 146 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  30.07 
 
 		 144 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  30.07 
 
 		 144 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5359  MaoC domain protein dehydratase  30.4 
 
 		 158 aa  46.2  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2820  hypothetical protein  29.06 
 
 		 129 aa  46.2  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  30.07 
 
 		 144 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  31.88 
 
 		 147 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0886  hypothetical protein  28.92 
 
 		 141 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2787  dehydratase  33.33 
 
 		 126 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231995  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  28.83 
 
 		 139 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0288  hypothetical protein  39.68 
 
 		 145 aa  43.5  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  26.14 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  28 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3701  hypothetical protein  29.79 
 
 		 405 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3320  dehydratase  29.84 
 
 		 132 aa  43.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000697318 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  21.36 
 
 		 337 aa  43.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>