71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1853 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1853  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  326  9e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0381844  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5359  MaoC domain protein dehydratase  48.03 
 
 
158 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3480  MaoC domain protein dehydratase  39.18 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5058  MaoC-like dehydratase  38.38 
 
 
143 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5254  MaoC-like dehydratase  37.37 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407222 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4759  dehydratase  38.38 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.533729  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4673  MaoC-like dehydratase  38.38 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1512  dehydratase  37.37 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2622  hypothetical protein  37.27 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0241614  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0062  MaoC domain protein dehydratase  38 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1483  hypothetical protein  35 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000382942  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8195  dehydratase  35.58 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0886  hypothetical protein  36.56 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3857  hypothetical protein  32 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.284543  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13574  hypothetical protein  35.42 
 
 
129 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2820  hypothetical protein  38.71 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2787  dehydratase  34.02 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231995  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3320  dehydratase  40.4 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000697318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2140  dehydratase  29.9 
 
 
148 aa  58.2  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0742  MaoC-like dehydratase  32.43 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0921523  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  31.82 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4070  dehydratase  34.41 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.353484  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3271  dehydratase  33.66 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3209  MaoC-like dehydratase  33.66 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205501  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3220  dehydratase  33.66 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216519  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03560  acyl dehydratase  33.33 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.210712  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  27.27 
 
 
141 aa  52.4  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
337 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  30.69 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  30.69 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0739  MaoC domain protein dehydratase  29.03 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  30.69 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0664  MaoC domain-containing protein  35.16 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  34 
 
 
139 aa  48.1  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0498  dehydratase  25.51 
 
 
137 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.14206  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  32.58 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  31.82 
 
 
142 aa  47.8  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0512  hypothetical protein  33.33 
 
 
326 aa  47.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2527  MaoC-like dehydratase  31.43 
 
 
139 aa  47.4  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  32.29 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  25.44 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  32.99 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  30.84 
 
 
335 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_463  acyl dehydratase  25.51 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  32.32 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0522  hypothetical protein  25.51 
 
 
137 aa  44.7  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000722837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6628  dehydratase  37.65 
 
 
126 aa  44.3  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.211111  normal  0.931834 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4069  dehydratase  30.84 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5849  hypothetical protein  36.27 
 
 
348 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0326756  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5452  hypothetical protein  36.27 
 
 
348 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080026  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5770  MaoC domain protein dehydratase  32.11 
 
 
149 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  29.41 
 
 
343 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1645  hypothetical protein  35.29 
 
 
348 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.817495  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0531  hypothetical protein  35.29 
 
 
348 aa  42.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.426838  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  30.1 
 
 
138 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  27.91 
 
 
343 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0552  hypothetical protein  35.29 
 
 
348 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0634  hypothetical protein  35.29 
 
 
348 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366687  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  27.91 
 
 
343 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  30.1 
 
 
138 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1672  hypothetical protein  35.29 
 
 
348 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  27.91 
 
 
343 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5645  hypothetical protein  35.29 
 
 
348 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  28.89 
 
 
141 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  30.1 
 
 
138 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1696  hypothetical protein  35.29 
 
 
348 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  27.91 
 
 
343 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  29.91 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  35.71 
 
 
138 aa  41.6  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  32.63 
 
 
141 aa  40.8  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  30.43 
 
 
127 aa  40.4  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>