45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4673 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_4759  dehydratase  100 
 
 
133 aa  269  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.533729  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4673  MaoC-like dehydratase  100 
 
 
133 aa  269  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5058  MaoC-like dehydratase  96.21 
 
 
143 aa  258  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1512  dehydratase  93.23 
 
 
133 aa  255  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5254  MaoC-like dehydratase  90.98 
 
 
133 aa  251  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407222 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13574  hypothetical protein  79.2 
 
 
129 aa  209  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0886  hypothetical protein  70.31 
 
 
141 aa  189  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3857  hypothetical protein  65.08 
 
 
138 aa  169  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.284543  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2787  dehydratase  59.84 
 
 
126 aa  149  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231995  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2622  hypothetical protein  59.32 
 
 
129 aa  147  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0241614  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3480  MaoC domain protein dehydratase  58.02 
 
 
143 aa  146  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2820  hypothetical protein  59.13 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8195  dehydratase  54.89 
 
 
136 aa  143  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0062  MaoC domain protein dehydratase  60.98 
 
 
133 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3320  dehydratase  50.81 
 
 
132 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000697318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2140  dehydratase  42.06 
 
 
148 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1853  hypothetical protein  38.38 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0381844  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5359  MaoC domain protein dehydratase  40.4 
 
 
158 aa  70.1  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1483  hypothetical protein  35.29 
 
 
152 aa  63.5  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000382942  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3209  MaoC-like dehydratase  31.3 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205501  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3220  dehydratase  31.3 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216519  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3271  dehydratase  31.3 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  31.73 
 
 
337 aa  50.8  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  28.57 
 
 
335 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  32.04 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  32.04 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  32.04 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  29.7 
 
 
138 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  29.7 
 
 
138 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3988  dehydratase  31.63 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  31.73 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  28.71 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  30.63 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  27.07 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  30.59 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  30.77 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  31.58 
 
 
142 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  30.43 
 
 
151 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4070  dehydratase  31.65 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.353484  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  30.39 
 
 
141 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  28.92 
 
 
141 aa  42.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  27.61 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  27.69 
 
 
141 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5770  MaoC domain protein dehydratase  27.27 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  25.38 
 
 
343 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>