30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2820 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2820  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  258  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2622  hypothetical protein  84.38 
 
 
129 aa  219  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0241614  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13574  hypothetical protein  60.16 
 
 
129 aa  159  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157487 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3857  hypothetical protein  61.16 
 
 
138 aa  152  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.284543  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1512  dehydratase  59.13 
 
 
133 aa  147  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5254  MaoC-like dehydratase  58.26 
 
 
133 aa  146  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407222 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4759  dehydratase  59.13 
 
 
133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.533729  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4673  MaoC-like dehydratase  59.13 
 
 
133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5058  MaoC-like dehydratase  58.26 
 
 
143 aa  144  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0886  hypothetical protein  56.56 
 
 
141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2787  dehydratase  55.83 
 
 
126 aa  136  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231995  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3480  MaoC domain protein dehydratase  53.23 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0062  MaoC domain protein dehydratase  55.83 
 
 
133 aa  131  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8195  dehydratase  53.33 
 
 
136 aa  128  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2140  dehydratase  42.86 
 
 
148 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3320  dehydratase  44.54 
 
 
132 aa  94.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000697318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5359  MaoC domain protein dehydratase  40.19 
 
 
158 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1853  hypothetical protein  38.71 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0381844  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3220  dehydratase  29.13 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216519  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3271  dehydratase  29.13 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3209  MaoC-like dehydratase  29.13 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205501  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1483  hypothetical protein  30.53 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000382942  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  34.09 
 
 
337 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0512  hypothetical protein  29.06 
 
 
326 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4070  dehydratase  30.7 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.353484  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  34.34 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  28.33 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  27.34 
 
 
142 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  27.36 
 
 
139 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  30 
 
 
151 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>