84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3320 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3320  dehydratase  100 
 
 		 132 aa  266  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000697318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0062  MaoC domain protein dehydratase  60.66 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3480  MaoC domain protein dehydratase  53.17 
 
 		 143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3857  hypothetical protein  49.59 
 
 		 138 aa  136  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.284543  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1512  dehydratase  51.61 
 
 		 133 aa  130  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5254  MaoC-like dehydratase  52.07 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5058  MaoC-like dehydratase  52.03 
 
 		 143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4759  dehydratase  50.81 
 
 		 133 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.533729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4673  MaoC-like dehydratase  50.81 
 
 		 133 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8195  dehydratase  46.51 
 
 		 136 aa  127  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0886  hypothetical protein  46.4 
 
 		 141 aa  124  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13574  hypothetical protein  49.19 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157487 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2140  dehydratase  43.08 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2787  dehydratase  50 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231995  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2622  hypothetical protein  47.93 
 
 		 129 aa  113  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0241614  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2820  hypothetical protein  44.54 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5359  MaoC domain protein dehydratase  40.57 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1483  hypothetical protein  40.54 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000382942  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1853  hypothetical protein  40.4 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0381844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4070  dehydratase  29.36 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.353484  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  30.28 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2677  dehydratase  30 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0345161 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  33.65 
 
 		 337 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5770  MaoC domain protein dehydratase  31.91 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0512  hypothetical protein  29.84 
 
 		 326 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  28.23 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  31.67 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  32.38 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  32.23 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  28.74 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  32.38 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  28.07 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0851  hypothetical protein  36.08 
 
 		 281 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.110102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3220  dehydratase  28.57 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  30 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3209  MaoC-like dehydratase  28.57 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205501  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  30 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  30 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3271  dehydratase  28.57 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  31.03 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  31.43 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  31.43 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2527  MaoC-like dehydratase  28.03 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1010  MaoC domain protein dehydratase  27.01 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  27.74 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03560  acyl dehydratase  25.6 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3988  dehydratase  29.41 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  28.23 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5027  putative acyl dehydratase  28.81 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000226168  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6628  dehydratase  36.52 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.211111  normal  0.931834 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  25.86 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  32.22 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2727  putative MaoC-like dehydratase  27.5 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  25 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4169  MaoC-like dehydratase  26.67 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116288  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  27.59 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0139  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  33.72 
 
 		 297 aa  44.3  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0121  dehydratase  32.56 
 
 		 297 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  26.45 
 
 		 335 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  25.42 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  25.47 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  28.24 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5120  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  27.38 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0742  MaoC-like dehydratase  28 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0921523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  27.27 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  24.06 
 
 		 343 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0287  dehydratase  25.56 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0195  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  35.38 
 
 		 315 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0391  dehydratase  26.72 
 
 		 322 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1231  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  27.38 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2779  MaoC domain protein dehydratase  22.5 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6065  dehydratase  24.14 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0739  MaoC domain protein dehydratase  25.88 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4091  hypothetical protein  31.17 
 
 		 431 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2738  MaoC domain protein dehydratase  23.01 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00396042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  25.89 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  23.31 
 
 		 343 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0498  dehydratase  22.22 
 
 		 137 aa  40.4  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.14206  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  22.86 
 
 		 339 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3812  MaoC-like dehydratase  29.13 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0106778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2872  MaoC domain protein dehydratase  22.5 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0936  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  26.19 
 
 		 142 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0919  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  26.19 
 
 		 142 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0891029  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  22.5 
 
 		 146 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>