15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0851 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0851  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.110102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4091  hypothetical protein  39.01 
 
 		 431 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4559  hypothetical protein  37.18 
 
 		 412 aa  176  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4532  hypothetical protein  33.47 
 
 		 393 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3229  hypothetical protein  30.83 
 
 		 382 aa  108  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.520523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3701  hypothetical protein  27.47 
 
 		 405 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3320  dehydratase  36.08 
 
 		 132 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000697318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3209  MaoC-like dehydratase  29.59 
 
 		 156 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205501  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3271  dehydratase  29.59 
 
 		 156 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3220  dehydratase  29.59 
 
 		 156 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1483  hypothetical protein  26.17 
 
 		 152 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000382942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2527  MaoC-like dehydratase  28.28 
 
 		 139 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0062  MaoC domain protein dehydratase  29.7 
 
 		 133 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3480  MaoC domain protein dehydratase  30.19 
 
 		 143 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  28 
 
 		 335 aa  42.4  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>