64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3229 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3229  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  801    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.520523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4532  hypothetical protein  74.4 
 
 		 393 aa  600  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4559  hypothetical protein  32.75 
 
 		 412 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4091  hypothetical protein  32.2 
 
 		 431 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0851  hypothetical protein  30.83 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.110102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3701  hypothetical protein  24.4 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  32.52 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  36 
 
 		 144 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  36 
 
 		 144 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3995  hypothetical protein  30.47 
 
 		 156 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.268116 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  35 
 
 		 144 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  33.02 
 
 		 145 aa  53.5  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  32.97 
 
 		 153 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0390  MaoC-like dehydratase  36 
 
 		 145 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306687 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2329  MaoC domain protein dehydratase  36.59 
 
 		 134 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.676407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  22.09 
 
 		 321 aa  50.4  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  29.89 
 
 		 148 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  27.54 
 
 		 319 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0980  dehydratase  37.21 
 
 		 147 aa  49.7  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2305  MaoC family protein  37.21 
 
 		 147 aa  49.7  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  26.09 
 
 		 151 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4051  dehydratase  32.95 
 
 		 140 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1674  MaoC domain-containing protein dehydratase  38.46 
 
 		 134 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0430305 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1998  MaoC-like dehydratase  33.33 
 
 		 184 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  32.14 
 
 		 149 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  33.72 
 
 		 149 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  33.73 
 
 		 147 aa  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2195  dehydratase  37.35 
 
 		 147 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2496  hypothetical protein  32.89 
 
 		 149 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  27.82 
 
 		 148 aa  46.6  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0193  dehydratase  29.55 
 
 		 136 aa  46.6  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  26.67 
 
 		 158 aa  46.2  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0907  dehydratase  33.33 
 
 		 167 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1778  hypothetical protein  30.26 
 
 		 149 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6218  dehydratase  32 
 
 		 177 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0206  dehydratase  25.24 
 
 		 133 aa  45.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0987  MaoC domain protein dehydratase  29.33 
 
 		 205 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.889012 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2926  putative MaoC-like dehydratase  33.72 
 
 		 147 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.997708  normal  0.0377556 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3661  dehydratase  31.91 
 
 		 148 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.831738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1081  dehydratase  28.26 
 
 		 135 aa  44.7  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0588  MaoC-like dehydratase  35.37 
 
 		 147 aa  43.9  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3597  dehydratase  32.53 
 
 		 158 aa  44.3  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.43263 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1596  MaoC domain protein dehydratase  34.62 
 
 		 149 aa  44.3  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.733518  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1355  acyl dehydratase  27.73 
 
 		 142 aa  44.3  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1232  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  28.41 
 
 		 177 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0391  dehydratase  23.93 
 
 		 322 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  30.69 
 
 		 151 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  30.34 
 
 		 152 aa  43.9  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3847  dehydratase  26.62 
 
 		 156 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  26.06 
 
 		 322 aa  43.5  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1672  MaoC-like dehydratase  35.06 
 
 		 146 aa  43.5  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0444565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  31.82 
 
 		 149 aa  43.5  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3596  dehydratase  36 
 
 		 150 aa  43.1  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4037  MaoC-like dehydratase  24.85 
 
 		 326 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257252  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6099  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  35.8 
 
 		 482 aa  43.1  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.249001  normal  0.018881 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3753  MaoC domain protein dehydratase  30.84 
 
 		 157 aa  43.1  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3467  MaoC-like dehydratase  37.5 
 
 		 145 aa  43.1  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.273532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3444  dehydratase  30.84 
 
 		 157 aa  43.1  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.523272  normal  0.0613814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  27.55 
 
 		 141 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  24.28 
 
 		 141 aa  42.7  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  27.55 
 
 		 141 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  27.55 
 
 		 141 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3838  MaoC-like dehydratase  28.83 
 
 		 156 aa  42.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0409  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  35.8 
 
 		 480 aa  42.7  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.935296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>