26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3701 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3701  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  831    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4559  hypothetical protein  26.83 
 
 
412 aa  93.6  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4532  hypothetical protein  25.54 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177036  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4091  hypothetical protein  24.18 
 
 
431 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3229  hypothetical protein  24.4 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.520523  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0851  hypothetical protein  27.47 
 
 
281 aa  66.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.110102  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3995  hypothetical protein  35.09 
 
 
156 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.268116 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  34.96 
 
 
151 aa  55.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0907  dehydratase  31.01 
 
 
167 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2496  hypothetical protein  34.83 
 
 
149 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  27.64 
 
 
144 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1778  hypothetical protein  32.18 
 
 
149 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  27.64 
 
 
144 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  27.64 
 
 
144 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0987  MaoC domain protein dehydratase  30.23 
 
 
205 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.889012 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2678  hypothetical protein  31.62 
 
 
159 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0349464 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1596  MaoC domain protein dehydratase  30.85 
 
 
149 aa  47  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.733518  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4426  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  34.26 
 
 
481 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4316  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  34.26 
 
 
481 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0531  hypothetical protein  25.79 
 
 
348 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.426838  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5645  hypothetical protein  25.79 
 
 
348 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0634  hypothetical protein  25.79 
 
 
348 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366687  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0552  hypothetical protein  25.79 
 
 
348 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4251  MaoC domain protein dehydratase  35.37 
 
 
220 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0512  hypothetical protein  29.79 
 
 
326 aa  43.5  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  31.46 
 
 
145 aa  43.5  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>