43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4532 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4532  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  811    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177036  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3229  hypothetical protein  74.4 
 
 
382 aa  600  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.520523  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4091  hypothetical protein  33.92 
 
 
431 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4559  hypothetical protein  33.33 
 
 
412 aa  176  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0851  hypothetical protein  33.47 
 
 
281 aa  120  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.110102  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3701  hypothetical protein  25.54 
 
 
405 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
151 aa  58.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  32.03 
 
 
158 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  21.77 
 
 
335 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  35.83 
 
 
144 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  35.83 
 
 
144 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  35.83 
 
 
144 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  27.94 
 
 
153 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0390  MaoC-like dehydratase  33.33 
 
 
145 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000306687 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  28.1 
 
 
145 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2329  MaoC domain protein dehydratase  34.55 
 
 
134 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.676407  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4051  dehydratase  35.29 
 
 
140 aa  50.4  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46056  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21190  acyl dehydratase  31.15 
 
 
180 aa  49.7  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  32.14 
 
 
148 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0898  hypothetical protein  34.83 
 
 
165 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.246332 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  27.27 
 
 
158 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1483  hypothetical protein  25.99 
 
 
152 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000382942  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3995  hypothetical protein  27.91 
 
 
156 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.268116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  26.92 
 
 
319 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  33.73 
 
 
149 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0907  dehydratase  29.91 
 
 
167 aa  47  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1674  MaoC domain-containing protein dehydratase  34.55 
 
 
134 aa  47  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0430305 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2496  hypothetical protein  30.77 
 
 
149 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  31.9 
 
 
149 aa  47  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4069  hypothetical protein  32.68 
 
 
166 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.389962  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1594  dehydratase  27.46 
 
 
161 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.691822  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0987  MaoC domain protein dehydratase  30.59 
 
 
205 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.889012 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  29.07 
 
 
147 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6218  dehydratase  35.06 
 
 
177 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1778  hypothetical protein  28.21 
 
 
149 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2872  MaoC domain protein dehydratase  26.89 
 
 
135 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  26.27 
 
 
150 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  26.27 
 
 
150 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2677  dehydratase  29.47 
 
 
135 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0345161 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  30.23 
 
 
149 aa  43.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  26.67 
 
 
151 aa  43.1  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  27.82 
 
 
148 aa  42.7  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  28.42 
 
 
146 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>