33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4559 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4559  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  848    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4091  hypothetical protein  40.93 
 
 		 431 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0851  hypothetical protein  37.18 
 
 		 281 aa  176  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.110102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4532  hypothetical protein  33.33 
 
 		 393 aa  176  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3229  hypothetical protein  32.75 
 
 		 382 aa  169  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.520523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3701  hypothetical protein  26.83 
 
 		 405 aa  93.6  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  28.78 
 
 		 151 aa  55.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  29.17 
 
 		 144 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  26.14 
 
 		 319 aa  53.5  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  33.33 
 
 		 141 aa  53.1  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  28.33 
 
 		 144 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  28.33 
 
 		 144 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4169  MaoC-like dehydratase  31.31 
 
 		 138 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116288  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1483  hypothetical protein  29.48 
 
 		 152 aa  51.2  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000382942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  32 
 
 		 139 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2528  hypothetical protein  29.69 
 
 		 149 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0907  dehydratase  26.9 
 
 		 167 aa  47  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  28.95 
 
 		 147 aa  47  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2677  dehydratase  31.91 
 
 		 135 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0345161 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1546  dehydratase  30.34 
 
 		 146 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154043  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2727  putative MaoC-like dehydratase  28.28 
 
 		 138 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3995  hypothetical protein  28.48 
 
 		 156 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.268116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  35.56 
 
 		 145 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  31.85 
 
 		 153 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  26.06 
 
 		 158 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4037  MaoC-like dehydratase  25.75 
 
 		 326 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257252  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0169  dehydratase  26.53 
 
 		 334 aa  44.3  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0997526  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  30.15 
 
 		 151 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  29.08 
 
 		 149 aa  43.9  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0391  dehydratase  25.93 
 
 		 322 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128192 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1356  (de)hydratase  29.52 
 
 		 141 aa  43.5  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5027  putative acyl dehydratase  29.29 
 
 		 138 aa  43.5  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000226168  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  29.79 
 
 		 146 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>