100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2528 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2528  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  308  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  59.73 
 
 		 146 aa  174  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4168  hypothetical protein  57.72 
 
 		 146 aa  169  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5026  hypothetical protein  57.72 
 
 		 146 aa  164  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000215714  normal  0.277815 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4756  hypothetical protein  52.38 
 
 		 147 aa  158  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  51.68 
 
 		 147 aa  158  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2939  hypothetical protein  50 
 
 		 150 aa  156  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  52.38 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0663  hypothetical protein  52.7 
 
 		 146 aa  154  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595218  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3987  hypothetical protein  46.15 
 
 		 152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1609  hypothetical protein  49.66 
 
 		 148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3813  hypothetical protein  45.64 
 
 		 148 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0202371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4070  hypothetical protein  47.65 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4077  hypothetical protein  42.95 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3723  hypothetical protein  42.95 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  42.28 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  42.28 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  41.61 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0448  hypothetical protein  36.42 
 
 		 170 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  36.84 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  35.34 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  36.18 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  36.18 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3212  MaoC-like dehydratase  35.53 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3274  dehydratase  35.53 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3223  dehydratase  35.53 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  34.72 
 
 		 335 aa  74.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  31.51 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0390  MaoC-like dehydratase  35.95 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  33.83 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  35.37 
 
 		 337 aa  72.4  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  33.83 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0898  hypothetical protein  35.66 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.246332 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  34.25 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  33.59 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  32.82 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  36.43 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  32.88 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  32.19 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21400  acyl dehydratase  30.82 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0000186279  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2693  MaoC domain protein dehydratase  32.19 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  33.59 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6647  hypothetical protein  33.56 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  36.3 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  37.5 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1778  hypothetical protein  29.23 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3027  hypothetical protein  37.5 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0288  hypothetical protein  31.3 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3183  MaoC domain protein dehydratase  30.67 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  32.8 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  31.78 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0070  MaoC-like dehydratase  33.01 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2678  hypothetical protein  28.3 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0349464 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0842  MaoC-like dehydratase  31.97 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.659825  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  30.56 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4039  hypothetical protein  31.58 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.798553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0666  dehydratase  30.89 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0686  dehydratase  30.89 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.169172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0673  MaoC-like dehydratase  30.89 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2496  hypothetical protein  29.45 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0664  hypothetical protein  32.74 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00923819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0562  hypothetical protein  31.21 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0892456  normal  0.0661028 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  24.84 
 
 		 319 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10650  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  31.16 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0506433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  29.23 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0920  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  30.88 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117088  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0948  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  30.88 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0937  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  30.88 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2780  hypothetical protein  31.76 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.189937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2873  hypothetical protein  31.76 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07680  hypothetical protein  30.77 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0469422 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  28.95 
 
 		 333 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2687  hypothetical protein  32.43 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5121  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  27.94 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0599  MaoC-like dehydratase  31.58 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598373  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10648  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  26.32 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.039671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4559  hypothetical protein  29.69 
 
 		 412 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21190  acyl dehydratase  31.06 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10515  hypothetical protein  29.17 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  28.46 
 
 		 343 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  28.46 
 
 		 343 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  28.48 
 
 		 352 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  26.95 
 
 		 318 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  26.95 
 
 		 318 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  28.46 
 
 		 343 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0670  hypothetical protein  28.77 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0367273  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  33.83 
 
 		 312 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  27.21 
 
 		 343 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1232  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  27.94 
 
 		 177 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4084  hypothetical protein  26.19 
 
 		 185 aa  43.9  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  26.24 
 
 		 317 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3995  hypothetical protein  25.4 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.268116 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  26.67 
 
 		 317 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2840  MaoC domain protein dehydratase  31.4 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0918  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  23.85 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0669251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0935  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  23.85 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  28.99 
 
 		 324 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  27.21 
 
 		 343 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5119  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  27.46 
 
 		 185 aa  41.2  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  25.52 
 
 		 311 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>