183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5027 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5027  putative acyl dehydratase  100 
 
 		 138 aa  286  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000226168  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4169  MaoC-like dehydratase  85.51 
 
 		 138 aa  251  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116288  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2727  putative MaoC-like dehydratase  79.71 
 
 		 138 aa  240  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2527  MaoC-like dehydratase  65.22 
 
 		 139 aa  194  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  62.32 
 
 		 138 aa  174  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  55.56 
 
 		 141 aa  168  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5770  MaoC domain protein dehydratase  57.35 
 
 		 149 aa  167  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  55.47 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0664  MaoC domain-containing protein  57.35 
 
 		 137 aa  156  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0157  dehydratase  54.69 
 
 		 137 aa  149  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3988  dehydratase  55.15 
 
 		 136 aa  148  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  54.48 
 
 		 138 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  54.48 
 
 		 138 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  54.48 
 
 		 138 aa  147  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3812  MaoC-like dehydratase  49.62 
 
 		 140 aa  133  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0106778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  51.59 
 
 		 141 aa  133  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4076  MaoC-like dehydratase  50 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3724  MaoC domain protein dehydratase  50 
 
 		 141 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4069  dehydratase  48.53 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0391  dehydratase  39.06 
 
 		 322 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128192 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4037  MaoC-like dehydratase  42.31 
 
 		 326 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257252  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4180  MaoC domain protein dehydratase  41.04 
 
 		 332 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128585  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4153  MaoC domain protein dehydratase  41.04 
 
 		 332 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  37.96 
 
 		 335 aa  95.5  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2497  MaoC domain protein dehydratase  36.03 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  36.3 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  36.3 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  36.3 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1777  MaoC domain protein dehydratase  31.62 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  40.94 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0742  MaoC-like dehydratase  38.97 
 
 		 142 aa  84.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0921523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0161  MaoC domain protein dehydratase  35.71 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.49242  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  36.92 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1010  MaoC domain protein dehydratase  46.51 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  34.56 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  39.86 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03560  acyl dehydratase  37.88 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  37.24 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  36.09 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  34.88 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  38.39 
 
 		 142 aa  70.1  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  43.9 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  44.05 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  32.31 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6065  dehydratase  44 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  32.31 
 
 		 337 aa  67.4  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0287  dehydratase  31.73 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10649  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  38.46 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0228319 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  34.96 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0600  MaoC domain protein dehydratase  39.77 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.552837  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  38.82 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  36.07 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0739  MaoC domain protein dehydratase  30.71 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  38.82 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  38.82 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  33.06 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  41.43 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  32.58 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0563  MaoC domain protein dehydratase  36.78 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.127994  normal  0.0650042 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  30.99 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2738  MaoC domain protein dehydratase  31.82 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00396042 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17510  acyl dehydratase  41.18 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.736026  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3940  dehydratase  41.89 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4332  dehydratase  41.89 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0062  MaoC domain protein dehydratase  34.48 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0947  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  33.33 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3182  MaoC domain protein dehydratase  45.83 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0456076 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21390  acyl dehydratase  34.23 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000515647  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  34.12 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  34.52 
 
 		 343 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3838  MaoC-like dehydratase  28.06 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  35.94 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1127  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32.14 
 
 		 472 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.345508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0919  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  33.94 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0891029  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0936  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  33.94 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1231  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  34.86 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5120  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  34.86 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0498  dehydratase  28.03 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.14206  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4100  MaoC-like domain protein  28.06 
 
 		 173 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1998  MaoC-like dehydratase  30.33 
 
 		 184 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1221  MaoC domain protein dehydratase  26.24 
 
 		 148 aa  52.8  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0229542 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3480  MaoC domain protein dehydratase  28.33 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1026  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  30 
 
 		 472 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30160  3-Re enoyl-CoA hydratase PhaJ  27.05 
 
 		 156 aa  50.1  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  35.21 
 
 		 279 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4356  MaoC-like dehydratase  26.28 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2692  MaoC domain protein dehydratase  34.12 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3209  MaoC-like dehydratase  29.1 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205501  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1355  acyl dehydratase  27.54 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3271  dehydratase  29.1 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3220  dehydratase  29.1 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3994  MaoC-like dehydratase  25.9 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.270876 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3315  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  31.21 
 
 		 470 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.745735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4552  MaoC domain protein dehydratase  26.5 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2781  dehydratase  36.84 
 
 		 282 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1493  dehydratase  27.83 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1337  dehydratase  26.5 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  28.03 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8195  dehydratase  31.9 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3847  dehydratase  26.5 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>