137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0498 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0498  dehydratase  100 
 
 
137 aa  273  5e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.14206  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0522  hypothetical protein  87.59 
 
 
137 aa  242  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000722837  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_463  acyl dehydratase  86.13 
 
 
137 aa  241  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0664  MaoC domain-containing protein  33.33 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2527  MaoC-like dehydratase  29.63 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5770  MaoC domain protein dehydratase  31.86 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  31.82 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  30.88 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4070  dehydratase  32.29 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.353484  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6065  dehydratase  30.63 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3724  MaoC domain protein dehydratase  30.43 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3812  MaoC-like dehydratase  32.52 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0106778  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  33.33 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  32.61 
 
 
138 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  32.61 
 
 
138 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  35.37 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17510  acyl dehydratase  31.87 
 
 
163 aa  62  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.736026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4076  MaoC-like dehydratase  29.51 
 
 
137 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  31.11 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1777  MaoC domain protein dehydratase  39.08 
 
 
133 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  43.86 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  30.43 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10649  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  30.37 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0228319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  30.15 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4069  dehydratase  32.54 
 
 
141 aa  60.1  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  30.63 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2727  putative MaoC-like dehydratase  28.03 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2497  MaoC domain protein dehydratase  31.75 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3994  MaoC-like dehydratase  24.65 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.270876 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  28.97 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  35.25 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1221  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0229542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0742  MaoC-like dehydratase  27.36 
 
 
142 aa  58.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0921523  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4169  MaoC-like dehydratase  30 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116288  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0600  MaoC domain protein dehydratase  38.2 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.552837  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0157  dehydratase  33.63 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21390  acyl dehydratase  50.94 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000515647  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2738  MaoC domain protein dehydratase  43.33 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00396042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  31.82 
 
 
141 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3940  dehydratase  40.98 
 
 
130 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4332  dehydratase  40.98 
 
 
130 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2692  MaoC domain protein dehydratase  46.3 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0919  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  30.66 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0891029  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  34.74 
 
 
343 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0936  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  30.66 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  34.74 
 
 
343 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  34.74 
 
 
343 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  30.95 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  30.49 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0947  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  29.2 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1010  MaoC domain protein dehydratase  30.95 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0161  MaoC domain protein dehydratase  27.88 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.49242  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  29.25 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  31.4 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3988  dehydratase  33 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  30.85 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03560  acyl dehydratase  34.62 
 
 
133 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.210712  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5027  putative acyl dehydratase  28.03 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000226168  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  31.75 
 
 
339 aa  53.5  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  32.53 
 
 
343 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0391  dehydratase  26.77 
 
 
322 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  33.82 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  30.59 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1231  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  28.47 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  35 
 
 
343 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  29.57 
 
 
337 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  26.67 
 
 
141 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  26.67 
 
 
141 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  26.67 
 
 
141 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2677  dehydratase  28.3 
 
 
135 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0345161 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4037  MaoC-like dehydratase  26.72 
 
 
326 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257252  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  41.82 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4153  MaoC domain protein dehydratase  26.77 
 
 
332 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4180  MaoC domain protein dehydratase  26.77 
 
 
332 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128585  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0563  MaoC domain protein dehydratase  40.74 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.127994  normal  0.0650042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5120  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  27.74 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  35.71 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  29.57 
 
 
335 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0739  MaoC domain protein dehydratase  28.83 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1594  dehydratase  26.87 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.691822  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1853  hypothetical protein  25.51 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0381844  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4178  dehydratase  25.2 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4100  MaoC-like domain protein  27.18 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6218  dehydratase  29.17 
 
 
177 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  31.53 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4316  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  27.07 
 
 
481 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4426  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  27.07 
 
 
481 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1998  MaoC-like dehydratase  27.12 
 
 
184 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3182  MaoC domain protein dehydratase  30.17 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0456076 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3847  dehydratase  27.88 
 
 
156 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1596  MaoC domain protein dehydratase  29.17 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.733518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6628  dehydratase  32.94 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.211111  normal  0.931834 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3480  MaoC domain protein dehydratase  22.64 
 
 
143 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3838  MaoC-like dehydratase  27.18 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4356  MaoC-like dehydratase  26.04 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4552  MaoC domain protein dehydratase  26.25 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228955  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1337  dehydratase  26.25 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4059  dehydratase  26.25 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  35.21 
 
 
279 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  23.64 
 
 
352 aa  42.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>