58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6628 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6628  dehydratase  100 
 
 
126 aa  246  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.211111  normal  0.931834 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4070  dehydratase  58.93 
 
 
147 aa  135  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.353484  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1483  hypothetical protein  31.01 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000382942  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1853  hypothetical protein  38.54 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0381844  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5359  MaoC domain protein dehydratase  29.46 
 
 
158 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0498  dehydratase  32.26 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.14206  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_463  acyl dehydratase  33.33 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3320  dehydratase  35.16 
 
 
132 aa  57  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000697318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  35.34 
 
 
151 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_002936  DET0522  hypothetical protein  31.18 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000722837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8195  dehydratase  30.71 
 
 
136 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2677  dehydratase  34.02 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0345161 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2787  dehydratase  29.23 
 
 
126 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231995  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  32.5 
 
 
337 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0886  hypothetical protein  35.63 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  32.29 
 
 
141 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4673  MaoC-like dehydratase  29.25 
 
 
133 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  32.29 
 
 
141 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4759  dehydratase  29.25 
 
 
133 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.533729  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  32.29 
 
 
141 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5058  MaoC-like dehydratase  28.3 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2779  MaoC domain protein dehydratase  30.53 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0391  dehydratase  31.96 
 
 
322 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128192 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  34.38 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5254  MaoC-like dehydratase  28.3 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407222 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  33.88 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1512  dehydratase  29.25 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2872  MaoC domain protein dehydratase  30.53 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  29.47 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3857  hypothetical protein  28.46 
 
 
138 aa  47.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.284543  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4180  MaoC domain protein dehydratase  30.51 
 
 
332 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128585  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4153  MaoC domain protein dehydratase  30.51 
 
 
332 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0062  MaoC domain protein dehydratase  26.8 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4037  MaoC-like dehydratase  30.51 
 
 
326 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257252  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5770  MaoC domain protein dehydratase  31.25 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13574  hypothetical protein  29.51 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3480  MaoC domain protein dehydratase  26.88 
 
 
143 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  37.08 
 
 
280 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  36 
 
 
141 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  32.28 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3209  MaoC-like dehydratase  31.51 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205501  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  30.08 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3220  dehydratase  31.51 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216519  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3271  dehydratase  31.51 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0739  MaoC domain protein dehydratase  27.16 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0287  dehydratase  31.96 
 
 
159 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  32.81 
 
 
155 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  30 
 
 
138 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  30 
 
 
138 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  32.94 
 
 
280 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1221  MaoC domain protein dehydratase  31.52 
 
 
148 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0229542 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0512  hypothetical protein  27.55 
 
 
326 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  29 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1289  MaoC-like dehydratase  28.57 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0742  MaoC-like dehydratase  26.83 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0921523  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3988  dehydratase  29.9 
 
 
136 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1830  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  30.3 
 
 
290 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.288038 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  27.08 
 
 
901 aa  40  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>