52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5359 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5359  MaoC domain protein dehydratase  100 
 
 
158 aa  323  8.000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1853  hypothetical protein  48.03 
 
 
159 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0381844  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3480  MaoC domain protein dehydratase  41.41 
 
 
143 aa  87  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1483  hypothetical protein  35.82 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000382942  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3857  hypothetical protein  41.12 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.284543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0062  MaoC domain protein dehydratase  40.2 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2622  hypothetical protein  40.19 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0241614  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2787  dehydratase  38.76 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231995  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8195  dehydratase  35.04 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0886  hypothetical protein  40.95 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2820  hypothetical protein  40.19 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3220  dehydratase  39.02 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216519  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5058  MaoC-like dehydratase  40.4 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3271  dehydratase  39.02 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3209  MaoC-like dehydratase  39.02 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205501  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1512  dehydratase  39.42 
 
 
133 aa  70.5  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4673  MaoC-like dehydratase  40.4 
 
 
133 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4759  dehydratase  40.4 
 
 
133 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.533729  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5254  MaoC-like dehydratase  40.21 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407222 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13574  hypothetical protein  38.78 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157487 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3320  dehydratase  40.57 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000697318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2140  dehydratase  32.04 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4070  dehydratase  31.72 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.353484  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  36.15 
 
 
141 aa  53.9  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  34.38 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0664  MaoC domain-containing protein  43.84 
 
 
137 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2527  MaoC-like dehydratase  33.33 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  34.45 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  34.45 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3994  MaoC-like dehydratase  28.93 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.270876 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  34.45 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  35.92 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0512  hypothetical protein  30.4 
 
 
326 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3988  dehydratase  33.33 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  28.06 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  37.65 
 
 
151 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5452  hypothetical protein  35.87 
 
 
348 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080026  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5849  hypothetical protein  35.87 
 
 
348 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0326756  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1645  hypothetical protein  35.87 
 
 
348 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.817495  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0391  dehydratase  29.01 
 
 
322 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128192 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1696  hypothetical protein  35.87 
 
 
348 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1672  hypothetical protein  35.87 
 
 
348 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  30.09 
 
 
142 aa  42.4  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0634  hypothetical protein  34.78 
 
 
348 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366687  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0552  hypothetical protein  34.78 
 
 
348 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0531  hypothetical protein  34.78 
 
 
348 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.426838  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5645  hypothetical protein  34.78 
 
 
348 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2727  putative MaoC-like dehydratase  36.99 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  31.25 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5027  putative acyl dehydratase  36.62 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000226168  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5770  MaoC domain protein dehydratase  36.84 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0742  MaoC-like dehydratase  30.28 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0921523  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>