35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2622 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2622  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  257  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0241614  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2820  hypothetical protein  84.38 
 
 		 129 aa  219  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13574  hypothetical protein  63.64 
 
 		 129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157487 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3857  hypothetical protein  61.29 
 
 		 138 aa  154  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.284543  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5254  MaoC-like dehydratase  59.83 
 
 		 133 aa  150  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4673  MaoC-like dehydratase  59.32 
 
 		 133 aa  147  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4759  dehydratase  59.32 
 
 		 133 aa  147  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.533729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1512  dehydratase  58.47 
 
 		 133 aa  146  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5058  MaoC-like dehydratase  59.32 
 
 		 143 aa  146  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0886  hypothetical protein  56.1 
 
 		 141 aa  136  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0062  MaoC domain protein dehydratase  58.33 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2787  dehydratase  57.5 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231995  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3480  MaoC domain protein dehydratase  55.65 
 
 		 143 aa  130  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8195  dehydratase  54.1 
 
 		 136 aa  130  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2140  dehydratase  43.65 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3320  dehydratase  47.93 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000697318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5359  MaoC domain protein dehydratase  40.19 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1853  hypothetical protein  37.27 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0381844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1483  hypothetical protein  31.96 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000382942  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  32.5 
 
 		 337 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3220  dehydratase  30.21 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3271  dehydratase  30.21 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3209  MaoC-like dehydratase  30.21 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205501  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0512  hypothetical protein  29.91 
 
 		 326 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  29.2 
 
 		 142 aa  47.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  29.2 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  27.64 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4070  dehydratase  27.27 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.353484  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  32.95 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  27.59 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  28.57 
 
 		 151 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  27.61 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  30.68 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  32.18 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  29.9 
 
 		 139 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>